More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3014 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  100 
 
 
198 aa  387  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  64.77 
 
 
203 aa  251  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  68.25 
 
 
196 aa  250  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  67.54 
 
 
202 aa  229  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  66.15 
 
 
202 aa  228  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  59.39 
 
 
196 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  59.67 
 
 
191 aa  204  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  60.43 
 
 
199 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  63.54 
 
 
201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  56.48 
 
 
196 aa  194  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  53.37 
 
 
209 aa  185  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  59.66 
 
 
233 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  44.83 
 
 
192 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  43.35 
 
 
192 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  39.8 
 
 
187 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  39.33 
 
 
185 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  42.94 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  41.15 
 
 
193 aa  118  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  42.18 
 
 
178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  39.9 
 
 
198 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  40.59 
 
 
198 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  38.55 
 
 
202 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  40.43 
 
 
204 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  42.77 
 
 
185 aa  98.2  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  40.11 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  44.88 
 
 
188 aa  94.7  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  35.87 
 
 
208 aa  94.7  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  34.64 
 
 
189 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  37.89 
 
 
190 aa  91.3  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  33.68 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  40.99 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  40.99 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  40.99 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  40.99 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  46 
 
 
361 aa  90.1  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  40.99 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  40.99 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  35.9 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  40.99 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  43.02 
 
 
195 aa  85.5  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  35.83 
 
 
199 aa  85.1  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  33.15 
 
 
190 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  40.37 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  35.26 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  42 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  42 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  42 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  36.08 
 
 
215 aa  82  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  35.26 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  34.68 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  34.68 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  39.13 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  33.13 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  31.88 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  42.72 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  37.27 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  36.8 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  25.57 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  37.59 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  30.83 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  33.1 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  27.61 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  34.55 
 
 
428 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  25.57 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  33.1 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  33.1 
 
 
396 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  33.1 
 
 
396 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  34.71 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  33.1 
 
 
396 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  31.95 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  38.73 
 
 
432 aa  68.6  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  33.11 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  31.97 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  28.48 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  33.08 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  29.51 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  29.52 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.34 
 
 
386 aa  65.9  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 
415 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1607  Chromate transporter  31.07 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.28 
 
 
392 aa  65.5  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  31.91 
 
 
401 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  32.31 
 
 
390 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  32.31 
 
 
390 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  29.29 
 
 
483 aa  65.1  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.94 
 
 
404 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  30.16 
 
 
393 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  28.35 
 
 
416 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  27.33 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  29.09 
 
 
454 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  30.71 
 
 
444 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  28.57 
 
 
379 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  29.75 
 
 
385 aa  63.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  27.55 
 
 
443 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.66 
 
 
441 aa  62.8  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  34.65 
 
 
171 aa  62.8  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  30.56 
 
 
392 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  30.56 
 
 
392 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  33.12 
 
 
418 aa  61.2  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36 
 
 
387 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>