More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1744 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  100 
 
 
195 aa  380  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  43.72 
 
 
189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  41.57 
 
 
183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  41.21 
 
 
183 aa  144  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  41.11 
 
 
193 aa  135  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  45.88 
 
 
179 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  42.17 
 
 
172 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  35.71 
 
 
179 aa  122  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  39.33 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  34.81 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  39.18 
 
 
171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  35.58 
 
 
187 aa  112  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  35.33 
 
 
172 aa  111  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  42.24 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  34.34 
 
 
393 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.29 
 
 
404 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.73 
 
 
391 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  33.94 
 
 
382 aa  102  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  34.32 
 
 
174 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 
387 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 
387 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  33.94 
 
 
376 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.15 
 
 
386 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  33.73 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.73 
 
 
379 aa  98.6  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0232  Chromate transporter  33.68 
 
 
182 aa  97.4  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  31.14 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  32.94 
 
 
389 aa  95.9  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  32.93 
 
 
379 aa  93.6  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  30.91 
 
 
420 aa  92.8  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  34.34 
 
 
176 aa  92  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  32.52 
 
 
174 aa  92  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  34.97 
 
 
184 aa  91.7  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  33.14 
 
 
173 aa  91.3  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  35.71 
 
 
378 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  37.69 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1743  chromate transport protein  34.81 
 
 
187 aa  89.7  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  35.47 
 
 
376 aa  89.4  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  27.61 
 
 
213 aa  88.2  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  34.38 
 
 
176 aa  87.8  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.16 
 
 
393 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  37.04 
 
 
190 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  33.85 
 
 
190 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  39.45 
 
 
154 aa  86.3  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  31.1 
 
 
174 aa  85.5  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  34.73 
 
 
174 aa  85.9  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  36.67 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  39.71 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2736  Chromate transporter  32.34 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.7368  normal  0.214658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.27 
 
 
382 aa  82.4  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  32.68 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  40.74 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3495  Chromate transporter  30.97 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2732  chromate transporter  30.91 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  30.46 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  34.36 
 
 
174 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  31.58 
 
 
415 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  28.79 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  29.55 
 
 
393 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  30.67 
 
 
167 aa  79  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2508  chromate transport protein  32.97 
 
 
189 aa  79  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2214  chromate transporter  32.97 
 
 
189 aa  79  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.707988  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  25.13 
 
 
483 aa  78.6  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  27.74 
 
 
418 aa  78.2  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  32.65 
 
 
417 aa  78.2  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  28.85 
 
 
428 aa  77.8  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  29.89 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.93 
 
 
441 aa  77.8  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  28.65 
 
 
393 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.63 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  29.31 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.14 
 
 
390 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.64 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  29.38 
 
 
393 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  28.65 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  27.43 
 
 
392 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  29.65 
 
 
393 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  25.29 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.43 
 
 
415 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  25.29 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  28.65 
 
 
393 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  26.86 
 
 
392 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  29.67 
 
 
461 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0233  Chromate transporter  35.43 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  27.44 
 
 
463 aa  75.1  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  25.29 
 
 
396 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  25.29 
 
 
396 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  25.29 
 
 
396 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  30.81 
 
 
446 aa  74.7  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  28.16 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0714  Chromate transporter  29.73 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  25.7 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1607  Chromate transporter  35.98 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  32.4 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2840  Chromate transporter  29.03 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127351  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1606  Chromate transporter  42.28 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  29.84 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1003  chromate transporter  34.16 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  29.19 
 
 
453 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1753  Chromate transporter  32.03 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>