More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0903 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  100 
 
 		 192 aa  376  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  97.92 
 
 		 192 aa  346  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  84.48 
 
 		 193 aa  272  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  64.94 
 
 		 193 aa  211  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  63.22 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  42.11 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  46.2 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  40.94 
 
 		 178 aa  134  9e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  43.29 
 
 		 198 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  40.59 
 
 		 187 aa  124  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  44.13 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  40.59 
 
 		 203 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  40.23 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  46.56 
 
 		 215 aa  121  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  44.83 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  44.27 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  44.05 
 
 		 202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  40.84 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  44.56 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  44.51 
 
 		 199 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  44.51 
 
 		 199 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  44.51 
 
 		 199 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  44.04 
 
 		 204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  41.04 
 
 		 191 aa  114  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  41.9 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  39.06 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  43.93 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  43.93 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  43.93 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  41.62 
 
 		 202 aa  111  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  45.61 
 
 		 208 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  38.92 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  36.84 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  40.22 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  41.1 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  43.43 
 
 		 361 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  45.03 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  40.56 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  47.09 
 
 		 226 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  38.78 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  47.09 
 
 		 226 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  47.09 
 
 		 226 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  43.53 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  37.2 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  50.79 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  42.14 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  34.92 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  28.72 
 
 		 208 aa  80.9  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  30.06 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  36.14 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  36.14 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  36.53 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  29.38 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  36.14 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  29.61 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  28.4 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  31.76 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  29.45 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  29.48 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  25 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  45.45 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  32.19 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  27.67 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  30.59 
 
 		 396 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  30.59 
 
 		 396 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  30.59 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  30.59 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  30.59 
 
 		 396 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  27.11 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  26.42 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  31.01 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  31.15 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  26.51 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  27.33 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.25 
 
 		 395 aa  68.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  29.51 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  29.7 
 
 		 392 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  30.94 
 
 		 392 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  30.88 
 
 		 392 aa  68.2  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  31.19 
 
 		 379 aa  67.8  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.77 
 
 		 392 aa  67.8  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  30.2 
 
 		 401 aa  67.8  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  30.18 
 
 		 428 aa  67.8  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  28.19 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  27.27 
 
 		 443 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0053  Chromate transporter  37.06 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  32.28 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  28.86 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  40.78 
 
 		 408 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  30.43 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  30.94 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  31.11 
 
 		 385 aa  65.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  26.88 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  30.94 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  30.94 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1104  chromate transporter  34.48 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.590576  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  23.95 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  31.45 
 
 		 450 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  34.71 
 
 		 417 aa  65.1  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  28.24 
 
 		 449 aa  65.5  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>