More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0580 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  100 
 
 		 378 aa  731    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  74.2 
 
 		 390 aa  528  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  73.67 
 
 		 379 aa  508  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  61.74 
 
 		 383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  65 
 
 		 380 aa  438  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  53.42 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  54.88 
 
 		 383 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  54.29 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  52.82 
 
 		 395 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  52.56 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  55.15 
 
 		 418 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  55.41 
 
 		 418 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.15 
 
 		 418 aa  358  6e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  55.15 
 
 		 382 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  52.89 
 
 		 390 aa  354  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  52.11 
 
 		 390 aa  352  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  52.76 
 
 		 390 aa  346  4e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  51.05 
 
 		 390 aa  342  7e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  53.07 
 
 		 387 aa  329  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  51.75 
 
 		 402 aa  322  6e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  51.96 
 
 		 381 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  45.38 
 
 		 402 aa  277  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  42.82 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.78 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.78 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  42.31 
 
 		 404 aa  270  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  43.04 
 
 		 415 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.19 
 
 		 407 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  43.81 
 
 		 401 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  43.81 
 
 		 401 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  43.81 
 
 		 401 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  44.07 
 
 		 401 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  45.81 
 
 		 413 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  43.81 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  46.11 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  40.87 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  43.24 
 
 		 397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  43.56 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  42.34 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  42.16 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  44.39 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  43.92 
 
 		 425 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  42.16 
 
 		 393 aa  253  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  43.65 
 
 		 388 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  42.33 
 
 		 403 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  41.13 
 
 		 393 aa  249  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  43.55 
 
 		 411 aa  249  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  41.9 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  41.65 
 
 		 393 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  41.9 
 
 		 393 aa  249  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  45.68 
 
 		 407 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.03 
 
 		 411 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  45.68 
 
 		 407 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  41.84 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.03 
 
 		 411 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  43.31 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  41.82 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.83 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  45 
 
 		 409 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  41.65 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  43.28 
 
 		 408 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  43.99 
 
 		 417 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  39.52 
 
 		 430 aa  239  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  44.16 
 
 		 401 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3452  hypothetical protein  47.43 
 
 		 405 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758612  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  42.97 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  41.93 
 
 		 403 aa  235  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  44.68 
 
 		 408 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  41.49 
 
 		 398 aa  233  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  43.52 
 
 		 403 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  43.26 
 
 		 403 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  41.84 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  46.42 
 
 		 405 aa  229  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.16 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4856  putative transporter  43.4 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1773  chromate transporter  43.4 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0287413 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  40.7 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  41.74 
 
 		 404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  40.62 
 
 		 396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  41.76 
 
 		 392 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.38 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0120  chromate transporter  43.64 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.320143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  36.91 
 
 		 392 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.41 
 
 		 403 aa  219  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1101  chromate transporter  40.73 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.94 
 
 		 407 aa  210  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  42.86 
 
 		 346 aa  205  8e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1287  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.39 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  42.09 
 
 		 407 aa  202  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1023  chromate transporter  42.05 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.05 
 
 		 404 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1930  chromate transporter  40.67 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.53 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1603  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.48 
 
 		 400 aa  155  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.312378 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1209  chromate transporter  39.47 
 
 		 416 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89366  CHR family transporter: chromate ion  27.66 
 
 		 476 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0609883 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03341  chromate ion transporter (Eurofung)  28.85 
 
 		 510 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.156083  normal  0.912193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.35 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.53 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  29.41 
 
 		 382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>