More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0357 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  100 
 
 
173 aa  333  7e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  40.24 
 
 
172 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  45.24 
 
 
186 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  43.28 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  36.47 
 
 
174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  33.14 
 
 
172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  41.24 
 
 
176 aa  111  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  37.06 
 
 
171 aa  102  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  33.94 
 
 
179 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  34.52 
 
 
420 aa  100  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  34.36 
 
 
189 aa  99.4  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  37.06 
 
 
185 aa  96.7  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  34.52 
 
 
167 aa  94.4  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  32.54 
 
 
416 aa  94.4  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  38.17 
 
 
187 aa  93.2  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1606  Chromate transporter  37.36 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  29.61 
 
 
213 aa  91.7  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  33.14 
 
 
195 aa  91.3  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  31.93 
 
 
203 aa  90.1  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  32.72 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  28.14 
 
 
184 aa  88.2  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  28.14 
 
 
193 aa  87  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  32.56 
 
 
199 aa  85.1  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  32.72 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  32.56 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  32.75 
 
 
379 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  29.34 
 
 
393 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.76 
 
 
404 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.91 
 
 
387 aa  80.9  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  29.76 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  29.7 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  28.29 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0714  Chromate transporter  31.33 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.3 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2736  Chromate transporter  28.82 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.7368  normal  0.214658 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1753  Chromate transporter  36.63 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0233  Chromate transporter  34.57 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2508  chromate transport protein  33.59 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2214  chromate transporter  33.59 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.707988  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1103  chromate transporter  38.1 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.295774  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  36.8 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  26.67 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1003  chromate transporter  38.1 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  28.93 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  28.46 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.93 
 
 
472 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  26.42 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  29.41 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  29.24 
 
 
181 aa  73.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  26.97 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  33.83 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.12 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3496  Chromate transporter  35.66 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0727  Chromate transporter  37.12 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000305738 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  27.54 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1741  chromate transporter  27.82 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  29.33 
 
 
376 aa  72.4  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.31 
 
 
472 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  30.99 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2732  chromate transporter  32.06 
 
 
184 aa  72  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.21 
 
 
352 aa  72  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0232  Chromate transporter  30.77 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  26.42 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  27.63 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  33.1 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  39.53 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.38 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  25.79 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  26.97 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  28.16 
 
 
389 aa  68.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2841  Chromate transporter  25.88 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000452935  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1743  chromate transport protein  31.75 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1002  chromate transporter  27.89 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.815212  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1023  chromate transporter  35.29 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  25 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  24.4 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1104  chromate transporter  28.57 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.590576  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  32.61 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  24.38 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0104  Chromate transporter  30.71 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000372126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2840  Chromate transporter  27.06 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127351  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0458  putative chromate transport protein  40.3 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0394959  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  31.01 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  28.1 
 
 
376 aa  64.3  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  29.65 
 
 
393 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.54 
 
 
391 aa  64.3  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0471  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.71 
 
 
430 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  30.49 
 
 
378 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.89 
 
 
441 aa  63.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0466  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.71 
 
 
444 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.56 
 
 
415 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  27.04 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  28.12 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0437  chromate transporter  32.32 
 
 
416 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  27.04 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  27.04 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  27.04 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  29.41 
 
 
154 aa  62.4  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  28.57 
 
 
175 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  25.55 
 
 
428 aa  62.4  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>