More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1023 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1023  chromate transporter  100 
 
 
166 aa  313  6e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1103  chromate transporter  44.58 
 
 
166 aa  122  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.295774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1003  chromate transporter  44.58 
 
 
166 aa  122  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  35.88 
 
 
174 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  36.47 
 
 
173 aa  104  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  36.59 
 
 
171 aa  100  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  34.1 
 
 
172 aa  94.4  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  36.93 
 
 
185 aa  89.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  30.41 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3496  Chromate transporter  29.61 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  34.34 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  30.95 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  29.31 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1753  Chromate transporter  29.14 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  29.83 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1606  Chromate transporter  31.61 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  30.36 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  29.88 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  30.77 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  28.04 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0466  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.85 
 
 
444 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0471  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.85 
 
 
430 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2508  chromate transport protein  30.98 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  29.17 
 
 
420 aa  70.9  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  28.99 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0458  putative chromate transport protein  35.56 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0394959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0437  chromate transporter  28.85 
 
 
416 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2214  chromate transporter  30.43 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.707988  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.22 
 
 
387 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  28.41 
 
 
379 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2841  Chromate transporter  30.86 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000452935  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  29.76 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  30.06 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  35.26 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.73 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  32.12 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  29.14 
 
 
416 aa  64.7  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  27.88 
 
 
195 aa  64.3  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  31.4 
 
 
213 aa  64.3  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  28.74 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0053  Chromate transporter  35.79 
 
 
195 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1104  chromate transporter  37.8 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.590576  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  37.04 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0233  Chromate transporter  34.71 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  28.03 
 
 
376 aa  63.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  27.98 
 
 
376 aa  63.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1002  chromate transporter  37.8 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.815212  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  27.91 
 
 
493 aa  62  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1743  chromate transport protein  34.69 
 
 
187 aa  61.2  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  26.59 
 
 
393 aa  61.6  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  39.76 
 
 
196 aa  61.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2736  Chromate transporter  41.54 
 
 
207 aa  61.2  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.7368  normal  0.214658 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  25.82 
 
 
187 aa  60.1  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.99 
 
 
392 aa  60.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  33.75 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.54 
 
 
404 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  35.63 
 
 
178 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0232  Chromate transporter  27.38 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  34.12 
 
 
199 aa  58.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.88 
 
 
395 aa  58.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  30.92 
 
 
176 aa  57.8  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.01 
 
 
379 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  26.45 
 
 
203 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2840  Chromate transporter  38.24 
 
 
180 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127351  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.07 
 
 
472 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  27.49 
 
 
389 aa  55.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0443  chromate transporter  32.47 
 
 
412 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  26.01 
 
 
376 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.62 
 
 
390 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  31.33 
 
 
408 aa  55.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1127  Chromate transporter  37.33 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  32.53 
 
 
191 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.62 
 
 
390 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  28.74 
 
 
174 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1741  chromate transporter  33.33 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11551  chromate transporter  37.84 
 
 
412 aa  55.1  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0167365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  23.08 
 
 
382 aa  54.7  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  28 
 
 
383 aa  54.7  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.11 
 
 
395 aa  54.7  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.58 
 
 
352 aa  54.7  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.48 
 
 
386 aa  54.3  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  24.4 
 
 
175 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  26.83 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  24.4 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  32.05 
 
 
397 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  33.33 
 
 
390 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  25.88 
 
 
193 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  38.03 
 
 
417 aa  53.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.68 
 
 
472 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  23.98 
 
 
393 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  32.05 
 
 
401 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2533  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.71 
 
 
348 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  30.14 
 
 
385 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  24.4 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  28.32 
 
 
407 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  36.71 
 
 
393 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  38.36 
 
 
387 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  34.67 
 
 
201 aa  52.4  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  29.66 
 
 
208 aa  52.4  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  28.32 
 
 
407 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>