More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2214 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2214  chromate transporter  100 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.707988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2508  chromate transport protein  99.47 
 
 		 189 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  47.06 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0104  Chromate transporter  44.32 
 
 		 186 aa  155  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000372126  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1743  chromate transport protein  39.25 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  34.95 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  42.64 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  37.89 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  34.97 
 
 		 171 aa  102  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  37.43 
 
 		 186 aa  99.4  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  38.46 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  34.07 
 
 		 179 aa  98.6  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  32.97 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  34.59 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  32.97 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  32.97 
 
 		 183 aa  91.3  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  31.52 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  40.37 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  33.33 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  33.58 
 
 		 185 aa  85.1  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  31.11 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  31.84 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  33.59 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  33.88 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0233  Chromate transporter  38.35 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  38.76 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  37.17 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1606  Chromate transporter  37.98 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  32.24 
 
 		 416 aa  78.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  28.33 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  28.88 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  27.47 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  32.54 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  32.54 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  35.66 
 
 		 420 aa  72.8  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.68 
 
 		 472 aa  71.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  28.88 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  26.63 
 
 		 167 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.11 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.2 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  28.42 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  34.82 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.23 
 
 		 386 aa  67.8  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2736  Chromate transporter  29.12 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.7368  normal  0.214658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  25.41 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  27.27 
 
 		 401 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  25.56 
 
 		 393 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  28.96 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1741  chromate transporter  30.17 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.2 
 
 		 387 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  30.65 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  25 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  25.27 
 
 		 385 aa  64.7  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  25.98 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  26.23 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  25.98 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  28.4 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  25.36 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  30.63 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.18 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  25.54 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  25.36 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1127  Chromate transporter  31.25 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  25.23 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2533  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.1 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0232  Chromate transporter  33.05 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  20.99 
 
 		 392 aa  62.4  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  25.98 
 
 		 444 aa  62  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  30.89 
 
 		 172 aa  62  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  27.5 
 
 		 397 aa  62  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  24.24 
 
 		 401 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  25.2 
 
 		 446 aa  61.6  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.96 
 
 		 441 aa  61.6  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  30.97 
 
 		 383 aa  61.6  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  28.57 
 
 		 382 aa  61.6  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  30.09 
 
 		 390 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  30.09 
 
 		 418 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  31.78 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  34.15 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.09 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  30.09 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  25.83 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  30.09 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.32 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  30.09 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1603  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.54 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.312378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  29.2 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  25.98 
 
 		 453 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  31.45 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  25.9 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  25.56 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  31.87 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  27.01 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.63 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  28.15 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  33.05 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  21.54 
 
 		 394 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.46 
 
 		 408 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.46 
 
 		 408 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  24.6 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.323938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>