284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0479 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  100 
 
 		 180 aa  357  6e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  42.26 
 
 		 172 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  32.2 
 
 		 181 aa  110  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  35.84 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  31.79 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  34.88 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  31.79 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  34.88 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  34.88 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  34.88 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  34.3 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  34.3 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  36.05 
 
 		 176 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  38.01 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  35.33 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1333  chromate transporter  76.47 
 
 		 71 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.989506  hitchhiker  0.0000000000864753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  35.09 
 
 		 173 aa  101  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  35.67 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  37.97 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  34.88 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  34.81 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  34.81 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  35.71 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  34.81 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  34.81 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  34.81 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  34.81 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  34.81 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  34.18 
 
 		 176 aa  92  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1332  chromate transporter  84.91 
 
 		 53 aa  90.9  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000281267 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  30.99 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  32.91 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  31.1 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  31.17 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  33.54 
 
 		 177 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  31.55 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  29.09 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  35 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  30.26 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  29.61 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  29.07 
 
 		 172 aa  77.4  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  28.07 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  30.95 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  31.79 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  32.84 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  30.06 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  30.94 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  29.61 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  30.25 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  32.26 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  27.91 
 
 		 200 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  31.71 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  28.35 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  27.61 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  28.03 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  31.45 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  26.92 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  26.92 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  28.82 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  31.5 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  29.8 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  28.87 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  29.17 
 
 		 382 aa  65.1  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.03 
 
 		 392 aa  64.7  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  27.62 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  46.58 
 
 		 385 aa  64.7  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  35.71 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  26.4 
 
 		 416 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  33.59 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  26.67 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  29.12 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  30.51 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  26.97 
 
 		 393 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  28.95 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.01 
 
 		 472 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.01 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.56 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1743  chromate transport protein  27.49 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  26.75 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  31.36 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0648  chromate transporter  29.22 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28 
 
 		 379 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  26.11 
 
 		 392 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  36.36 
 
 		 397 aa  58.2  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  30.77 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.16 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.8 
 
 		 395 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  25.32 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.96 
 
 		 390 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.53 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  37.63 
 
 		 401 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  29.86 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  29.79 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  29.79 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  25.18 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  29.27 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0924  chromate transporter  30.56 
 
 		 400 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.175699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  26.8 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  23.78 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  23.31 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>