More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0939 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  100 
 
 
180 aa  345  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  99.44 
 
 
180 aa  343  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  98.89 
 
 
180 aa  342  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  95.51 
 
 
179 aa  308  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  88.2 
 
 
179 aa  307  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  66.86 
 
 
200 aa  226  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  50.35 
 
 
178 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  50.75 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  40.74 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  41.36 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  40.74 
 
 
175 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  40.74 
 
 
175 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  40.74 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  40.74 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  40.74 
 
 
175 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  38.61 
 
 
173 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  40.4 
 
 
176 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  38.61 
 
 
173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  40.51 
 
 
176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  38.24 
 
 
181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  38.46 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  38.46 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  38.46 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  38.46 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  38.46 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  38.46 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  41.18 
 
 
176 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  37.82 
 
 
176 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  37.04 
 
 
175 aa  112  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  35.4 
 
 
176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  35.22 
 
 
176 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  34.78 
 
 
176 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  40.36 
 
 
172 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  41.61 
 
 
177 aa  103  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  42.57 
 
 
170 aa  102  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  38.58 
 
 
177 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  35.95 
 
 
174 aa  97.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  37.29 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  36.57 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  32.7 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  36.13 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  31.52 
 
 
172 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  32.72 
 
 
172 aa  88.6  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  32.52 
 
 
180 aa  87.8  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  31.71 
 
 
416 aa  87.4  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  40.37 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  29.33 
 
 
420 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  29.3 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  27.78 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  30.25 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  31.5 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  32.48 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  31.79 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  29.22 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.71 
 
 
472 aa  71.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  34.53 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.5 
 
 
472 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0955  chromate transporter  35.53 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.457444  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  29.41 
 
 
198 aa  67.8  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  28.28 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  30.32 
 
 
200 aa  67.8  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  26.67 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  29.52 
 
 
212 aa  67  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  28.66 
 
 
202 aa  67  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  30.32 
 
 
200 aa  67  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  30.32 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  30.33 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  26.02 
 
 
185 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  30.77 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  31.33 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  30.08 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  26.88 
 
 
393 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  29.27 
 
 
174 aa  62  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.26 
 
 
415 aa  61.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3423  chromate transporter, permease component  28.85 
 
 
400 aa  61.2  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  31.45 
 
 
192 aa  61.2  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  33.06 
 
 
397 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  25.45 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  28.98 
 
 
493 aa  60.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  37.98 
 
 
383 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  29.49 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  29.68 
 
 
379 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1603  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.79 
 
 
400 aa  59.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.312378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.89 
 
 
393 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11551  chromate transporter  28.85 
 
 
412 aa  58.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0167365 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0471  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.93 
 
 
430 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0466  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.93 
 
 
444 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  23.67 
 
 
193 aa  58.5  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.68 
 
 
391 aa  58.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  36.59 
 
 
399 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  25.16 
 
 
183 aa  58.5  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.73 
 
 
387 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0443  chromate transporter  28.3 
 
 
412 aa  58.2  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.93 
 
 
441 aa  57.8  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  33.64 
 
 
394 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  32.14 
 
 
396 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  32.14 
 
 
396 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1741  chromate transporter  38.46 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  27.43 
 
 
213 aa  57  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  32.14 
 
 
396 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>