284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3423 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3423  chromate transporter, permease component  100 
 
 
400 aa  794    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1603  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.75 
 
 
400 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.312378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2707  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.93 
 
 
395 aa  331  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1000  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.36 
 
 
397 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2059  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.46 
 
 
394 aa  253  5.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0581027 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  28.57 
 
 
393 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  28.64 
 
 
393 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  29.83 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  28.37 
 
 
493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  29.08 
 
 
393 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  28.33 
 
 
393 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  28.43 
 
 
393 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  27.91 
 
 
393 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  28.09 
 
 
393 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  27.81 
 
 
393 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  27.85 
 
 
393 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  28.81 
 
 
393 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  29.38 
 
 
383 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  30.23 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  27.06 
 
 
413 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  27.32 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  29.43 
 
 
402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89366  CHR family transporter: chromate ion  25.75 
 
 
476 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0609883 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  28.28 
 
 
401 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  28.21 
 
 
415 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  29.61 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  27.78 
 
 
388 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  30.21 
 
 
409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  30.38 
 
 
346 aa  126  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.49 
 
 
408 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.49 
 
 
408 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  28.12 
 
 
401 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  27.19 
 
 
425 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  27.62 
 
 
383 aa  123  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  29.76 
 
 
390 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  26.25 
 
 
403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  29.19 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.74 
 
 
407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  27.62 
 
 
392 aa  117  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  28.49 
 
 
383 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  29.91 
 
 
390 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  27.48 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.57 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  27.32 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  28.03 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  27.81 
 
 
387 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.57 
 
 
400 aa  113  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  27.53 
 
 
412 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  28.28 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  29.08 
 
 
390 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  26.4 
 
 
401 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  26.4 
 
 
401 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  26.4 
 
 
401 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  25.83 
 
 
403 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  29.38 
 
 
379 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  28.78 
 
 
380 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  27.76 
 
 
401 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  28.49 
 
 
390 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  26.22 
 
 
383 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.2 
 
 
391 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  27.03 
 
 
404 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.71 
 
 
404 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.09 
 
 
411 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.09 
 
 
411 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  26.87 
 
 
390 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  25.55 
 
 
401 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  25.06 
 
 
403 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  25.3 
 
 
401 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  27.43 
 
 
394 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  27.57 
 
 
418 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  25.5 
 
 
395 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.03 
 
 
418 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  24.87 
 
 
379 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  27.27 
 
 
418 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  25.15 
 
 
386 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  27.03 
 
 
382 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  24.05 
 
 
382 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  28.06 
 
 
383 aa  99.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.88 
 
 
386 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  24.44 
 
 
463 aa  96.3  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1101  chromate transporter  28.94 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  28.27 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26 
 
 
387 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  25.41 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.12 
 
 
387 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.14 
 
 
379 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  25.7 
 
 
402 aa  90.9  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  27.87 
 
 
381 aa  89.7  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  24.32 
 
 
376 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  22.13 
 
 
389 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1773  chromate transporter  35.56 
 
 
426 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0287413 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  25.91 
 
 
432 aa  87.8  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  31.58 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  31.58 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  23.94 
 
 
376 aa  87  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  22.97 
 
 
469 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  23.99 
 
 
467 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  21.48 
 
 
483 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  23.21 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0120  chromate transporter  37.3 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.320143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>