287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2059 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2059  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 
394 aa  760    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0581027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1603  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.88 
 
 
400 aa  296  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.312378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3423  chromate transporter, permease component  39.46 
 
 
400 aa  282  8.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1000  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.1 
 
 
397 aa  275  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2707  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.48 
 
 
395 aa  259  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  32.12 
 
 
393 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  31.35 
 
 
393 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  31.76 
 
 
397 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  32.64 
 
 
393 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  32.9 
 
 
393 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  32.99 
 
 
393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  32.64 
 
 
393 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  32.3 
 
 
393 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  30 
 
 
493 aa  152  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  32.73 
 
 
393 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  32.19 
 
 
393 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  32.04 
 
 
393 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  32.63 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89366  CHR family transporter: chromate ion  28.57 
 
 
476 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0609883 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  31.47 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  30.34 
 
 
415 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  29.77 
 
 
401 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  32.49 
 
 
398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  29.91 
 
 
388 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.73 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.51 
 
 
408 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.51 
 
 
408 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  29.62 
 
 
430 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.33 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  31.61 
 
 
425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  29.47 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  27.18 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  29.81 
 
 
392 aa  127  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  30.21 
 
 
402 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  30.79 
 
 
383 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  28.53 
 
 
378 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  29.27 
 
 
404 aa  123  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  32.17 
 
 
390 aa  123  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  28.28 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  28.28 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  28.28 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  27.25 
 
 
395 aa  121  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  28.75 
 
 
403 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  28.29 
 
 
412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  29.97 
 
 
394 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  27.94 
 
 
383 aa  119  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  29.09 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  29.17 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  30.1 
 
 
383 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  27.94 
 
 
413 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  29.49 
 
 
408 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  28.28 
 
 
401 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  28.61 
 
 
407 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  28.61 
 
 
407 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.65 
 
 
405 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  29.38 
 
 
403 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.32 
 
 
400 aa  116  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  28.28 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  30.28 
 
 
412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  29.67 
 
 
390 aa  113  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  28.36 
 
 
386 aa  113  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  27.7 
 
 
402 aa  113  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  30.32 
 
 
379 aa  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  28.99 
 
 
380 aa  112  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  27.93 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  31.59 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.61 
 
 
403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.13 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  28.03 
 
 
392 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.51 
 
 
411 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.51 
 
 
411 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  31.61 
 
 
404 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  28.19 
 
 
390 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  27.58 
 
 
390 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.66 
 
 
387 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  28.68 
 
 
390 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.13 
 
 
387 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1773  chromate transporter  30.28 
 
 
426 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0287413 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  24.87 
 
 
393 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  30.59 
 
 
417 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.68 
 
 
407 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0120  chromate transporter  30.56 
 
 
387 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.320143  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  27.78 
 
 
382 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  29.06 
 
 
392 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  29.2 
 
 
383 aa  99.8  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  24.12 
 
 
420 aa  97.8  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.33 
 
 
386 aa  97.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.89 
 
 
443 aa  97.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  29.55 
 
 
381 aa  96.3  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  24.81 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  23.95 
 
 
379 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1930  chromate transporter  38.1 
 
 
330 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548978  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03341  chromate ion transporter (Eurofung)  32.2 
 
 
510 aa  90.5  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.156083  normal  0.912193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  27.94 
 
 
403 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1023  chromate transporter  33.54 
 
 
398 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  25.45 
 
 
382 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05427  chromate ion transporter (Eurofung)  38.58 
 
 
523 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00300888  normal  0.119006 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  35.67 
 
 
174 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.51 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  35.8 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>