More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1603 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1603  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 		 400 aa  799    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.312378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2707  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  58.99 
 
 		 395 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3423  chromate transporter, permease component  46.75 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1000  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.22 
 
 		 397 aa  282  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2059  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.88 
 
 		 394 aa  273  6e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0581027 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  32.35 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  30.88 
 
 		 493 aa  177  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  32.04 
 
 		 393 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  32.3 
 
 		 393 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  31.61 
 
 		 393 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  31.61 
 
 		 393 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  32.04 
 
 		 393 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  33.42 
 
 		 393 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  32.38 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  32.03 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  31.35 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  31.61 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  30.98 
 
 		 415 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  30.77 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89366  CHR family transporter: chromate ion  29.79 
 
 		 476 aa  155  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0609883 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  31 
 
 		 398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  32.74 
 
 		 430 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  32.47 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  31.03 
 
 		 401 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.88 
 
 		 405 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  32.28 
 
 		 378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  29.88 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.63 
 
 		 407 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  30.82 
 
 		 425 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  30.13 
 
 		 413 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  29.4 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  29.4 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  29.4 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  29.38 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.92 
 
 		 391 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  28.42 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  34.21 
 
 		 346 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  29.4 
 
 		 401 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  29.37 
 
 		 430 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  29.15 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  32.5 
 
 		 394 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  30.73 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  31 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  30.9 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.33 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.33 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  30.37 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.14 
 
 		 403 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  30.45 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  28.97 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  28.77 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  27.6 
 
 		 408 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  28.5 
 
 		 411 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  28.73 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  30.23 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  30.41 
 
 		 390 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  29.03 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  28.21 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  29.68 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  30.03 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.78 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.75 
 
 		 387 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.85 
 
 		 407 aa  124  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  29.03 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  28.64 
 
 		 390 aa  122  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  29.26 
 
 		 416 aa  122  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.53 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  28.72 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  28.35 
 
 		 376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.29 
 
 		 387 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.48 
 
 		 411 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.48 
 
 		 411 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  27.37 
 
 		 379 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  28.17 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  28.39 
 
 		 392 aa  117  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  28.5 
 
 		 386 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  28.5 
 
 		 383 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  27.65 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  27.48 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  32.5 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  29 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  28.69 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  30.92 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.68 
 
 		 386 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  26.38 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  24.82 
 
 		 408 aa  99.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  25.77 
 
 		 389 aa  99.8  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  25.72 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  25.07 
 
 		 420 aa  97.4  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.42 
 
 		 379 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1023  chromate transporter  35.64 
 
 		 398 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  25.06 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.66 
 
 		 472 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  33.13 
 
 		 405 aa  94.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3452  hypothetical protein  33.33 
 
 		 405 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758612  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  26.6 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  35.62 
 
 		 174 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1930  chromate transporter  35.03 
 
 		 330 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  26 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.93 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>