More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0672 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  100 
 
 		 383 aa  749    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  61.74 
 
 		 378 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  63.03 
 
 		 390 aa  431  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  63.3 
 
 		 379 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  59.19 
 
 		 380 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  54.31 
 
 		 383 aa  398  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  53.85 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  55.73 
 
 		 386 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  55.03 
 
 		 383 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  56.01 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  54.13 
 
 		 383 aa  363  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  53.68 
 
 		 390 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  55.25 
 
 		 390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  56.53 
 
 		 387 aa  355  5.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  55.74 
 
 		 390 aa  353  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.08 
 
 		 418 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  54.81 
 
 		 418 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  55.01 
 
 		 382 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  54.55 
 
 		 418 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  51.08 
 
 		 402 aa  325  6e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  52.74 
 
 		 381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  45.41 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.5 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  42.42 
 
 		 412 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  43.7 
 
 		 415 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  46.11 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  43.67 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  44.77 
 
 		 401 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  43.73 
 
 		 413 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  44.2 
 
 		 393 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  42.09 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  45.75 
 
 		 417 aa  258  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  44.2 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  44.2 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  43.78 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  44.74 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  44.05 
 
 		 393 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  44.2 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  43.47 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  45.66 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  44.81 
 
 		 409 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  44.5 
 
 		 408 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  44.74 
 
 		 393 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  43.78 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  42.09 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  39.41 
 
 		 430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  41.85 
 
 		 425 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  41.27 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  41.27 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  41.27 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  45.04 
 
 		 396 aa  249  5e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.09 
 
 		 405 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  41.71 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  41.58 
 
 		 401 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  43.08 
 
 		 430 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.75 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.75 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  41.27 
 
 		 401 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  43.48 
 
 		 408 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  43.89 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  44.04 
 
 		 407 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.64 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  44.04 
 
 		 407 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  42.47 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  40.46 
 
 		 394 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4856  putative transporter  43.92 
 
 		 401 aa  239  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  42.05 
 
 		 411 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.78 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.27 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  44.12 
 
 		 412 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.27 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  42.42 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  43.9 
 
 		 405 aa  237  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.32 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  43.2 
 
 		 392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3452  hypothetical protein  44.72 
 
 		 405 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758612  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  42.7 
 
 		 403 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  41.02 
 
 		 401 aa  233  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  42.42 
 
 		 403 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0120  chromate transporter  42.82 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.320143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.28 
 
 		 443 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  41.5 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1101  chromate transporter  41.45 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1287  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.7 
 
 		 411 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  41.78 
 
 		 392 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.94 
 
 		 407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1773  chromate transporter  41.54 
 
 		 426 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0287413 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  36.98 
 
 		 392 aa  213  5.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1023  chromate transporter  45.16 
 
 		 398 aa  210  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  42.95 
 
 		 346 aa  199  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.68 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  42.78 
 
 		 407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1209  chromate transporter  41.53 
 
 		 416 aa  160  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1930  chromate transporter  38.51 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.61 
 
 		 386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  29.02 
 
 		 493 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.86 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3423  chromate transporter, permease component  30.12 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89366  CHR family transporter: chromate ion  28.37 
 
 		 476 aa  137  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0609883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  30.72 
 
 		 382 aa  135  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>