250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1000 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1000  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 		 397 aa  805    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1603  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.22 
 
 		 400 aa  272  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.312378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3423  chromate transporter, permease component  36.36 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2059  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.1 
 
 		 394 aa  249  6e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0581027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2707  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.58 
 
 		 395 aa  246  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  31.1 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  31.41 
 
 		 393 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  31.1 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  30.52 
 
 		 393 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  30.23 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  30.26 
 
 		 393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  30.26 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  29.97 
 
 		 393 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  28.31 
 
 		 430 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  28.7 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  25.19 
 
 		 493 aa  126  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  28.82 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  28.78 
 
 		 393 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  27.94 
 
 		 401 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  27.94 
 
 		 401 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  27.94 
 
 		 401 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  28.39 
 
 		 383 aa  122  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  28.43 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  28.49 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  29.89 
 
 		 386 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  27.35 
 
 		 383 aa  119  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  27.7 
 
 		 401 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  29.01 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  26.52 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  27.51 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  26.59 
 
 		 430 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.79 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  27.16 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  27.44 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89366  CHR family transporter: chromate ion  25.33 
 
 		 476 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0609883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  27.34 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  26.52 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  28.79 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  28.65 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  29.5 
 
 		 409 aa  113  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.79 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  28.64 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  28.25 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  28.03 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  26.82 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  29.55 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  26.97 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  26.74 
 
 		 383 aa  110  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  27.54 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  29.58 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  30.14 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  26.7 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.86 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  30.57 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  29.28 
 
 		 413 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  29.49 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.6 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  27.49 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  27.59 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  27.22 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  26.78 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  28.61 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  27.91 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  28.35 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  27.46 
 
 		 378 aa  97.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.36 
 
 		 379 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.98 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.98 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  25.72 
 
 		 417 aa  95.5  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  22.7 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.86 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  23.5 
 
 		 379 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.86 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  27.22 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  22.83 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  23.31 
 
 		 443 aa  90.9  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  24.03 
 
 		 376 aa  90.9  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.51 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1773  chromate transporter  40.31 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0287413 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  37.5 
 
 		 407 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  37.5 
 
 		 407 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  24.01 
 
 		 382 aa  87  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  23.28 
 
 		 393 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  33.89 
 
 		 411 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  23.96 
 
 		 442 aa  86.3  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.21 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  21.67 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1023  chromate transporter  35.76 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1287  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.84 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  36.43 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3452  hypothetical protein  36.09 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758612  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.3 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.79 
 
 		 443 aa  82.8  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  32.63 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  28.49 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  25.21 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  22.19 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  34.36 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1930  chromate transporter  32.78 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548978  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  34.27 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>