More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4045 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  100 
 
 		 405 aa  775    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  67.83 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  67.83 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3452  hypothetical protein  74.55 
 
 		 405 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758612  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  62.19 
 
 		 415 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  59.74 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  63.29 
 
 		 403 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  59.95 
 
 		 407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1773  chromate transporter  60.88 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0287413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  55.16 
 
 		 401 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  57.07 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  57.07 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  57.07 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  61.03 
 
 		 404 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  55.25 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  57.18 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  55.28 
 
 		 403 aa  371  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  54.77 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  54.77 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  56.87 
 
 		 413 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  53.73 
 
 		 412 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  55.22 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  56.82 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  57.07 
 
 		 401 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  56.89 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  55.08 
 
 		 408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  54.27 
 
 		 411 aa  356  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  55.06 
 
 		 403 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  61.58 
 
 		 392 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  52.48 
 
 		 402 aa  352  8.999999999999999e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  55.96 
 
 		 408 aa  352  8.999999999999999e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  49.87 
 
 		 393 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  57.22 
 
 		 417 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  61.22 
 
 		 392 aa  348  7e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  52.42 
 
 		 403 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  54.48 
 
 		 411 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  54.48 
 
 		 411 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  54.3 
 
 		 403 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  50.91 
 
 		 393 aa  342  7e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  54.26 
 
 		 401 aa  341  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.9 
 
 		 405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  49.14 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  52.64 
 
 		 430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  50.51 
 
 		 393 aa  334  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  54.05 
 
 		 398 aa  330  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  49.87 
 
 		 393 aa  330  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  50.13 
 
 		 393 aa  329  7e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  55.72 
 
 		 401 aa  328  7e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  49.61 
 
 		 393 aa  328  9e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  50.13 
 
 		 393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  50.13 
 
 		 393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1287  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  64.19 
 
 		 411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1023  chromate transporter  62.32 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  49.87 
 
 		 393 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  50.13 
 
 		 393 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4856  putative transporter  56.59 
 
 		 401 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  51.51 
 
 		 400 aa  319  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  53.22 
 
 		 404 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  50.38 
 
 		 409 aa  311  9e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.44 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  51.23 
 
 		 412 aa  305  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  51.65 
 
 		 391 aa  303  5.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  54.64 
 
 		 407 aa  295  7e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1101  chromate transporter  48.85 
 
 		 394 aa  290  4e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  47.4 
 
 		 394 aa  285  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  54.64 
 
 		 407 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0120  chromate transporter  53.48 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.320143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  43.6 
 
 		 383 aa  269  8e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  47.42 
 
 		 346 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  45.74 
 
 		 378 aa  249  9e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  43.05 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  41.62 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1930  chromate transporter  51.98 
 
 		 330 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548978  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  40.81 
 
 		 383 aa  242  9e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  41.86 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  45.14 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  40.42 
 
 		 392 aa  239  9e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  43.95 
 
 		 387 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  42.71 
 
 		 390 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  43.35 
 
 		 383 aa  233  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  41.82 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  42.86 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  42.23 
 
 		 404 aa  229  9e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  43.72 
 
 		 379 aa  227  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  43.33 
 
 		 418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  43.33 
 
 		 382 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.08 
 
 		 418 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  42.82 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  41.82 
 
 		 390 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  42.66 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  42.82 
 
 		 381 aa  196  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  41.99 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1209  chromate transporter  46.43 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  60.98 
 
 		 443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.55 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  34.58 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.77 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  52.9 
 
 		 158 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  32.65 
 
 		 378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  30.45 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>