More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1101 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1101  chromate transporter  100 
 
 
394 aa  741    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  76.65 
 
 
394 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  51.98 
 
 
415 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  45.66 
 
 
393 aa  329  6e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  49.87 
 
 
401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  52.48 
 
 
388 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  50.13 
 
 
402 aa  323  3e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  52.74 
 
 
425 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  50.77 
 
 
401 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  50.77 
 
 
401 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  53.11 
 
 
403 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  48.27 
 
 
430 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  50.77 
 
 
401 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50.13 
 
 
407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  51.81 
 
 
396 aa  318  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  45.15 
 
 
393 aa  316  4e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  46.46 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  50.26 
 
 
401 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  50 
 
 
401 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  50.26 
 
 
403 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  45.15 
 
 
393 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  46.41 
 
 
393 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  46.58 
 
 
397 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  51.97 
 
 
408 aa  309  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  45.15 
 
 
393 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  45.15 
 
 
393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  44.81 
 
 
393 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  52.07 
 
 
403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  50.4 
 
 
413 aa  305  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  44.9 
 
 
393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  52.67 
 
 
403 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  49.21 
 
 
408 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  52.29 
 
 
417 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  45.41 
 
 
393 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  52.59 
 
 
403 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  47.57 
 
 
408 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  47.57 
 
 
408 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50 
 
 
405 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50.39 
 
 
400 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  51.41 
 
 
401 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  49.35 
 
 
430 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  44.22 
 
 
412 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  48.59 
 
 
404 aa  286  5e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  48.31 
 
 
411 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4856  putative transporter  50.92 
 
 
401 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.23 
 
 
391 aa  277  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  46.61 
 
 
407 aa  276  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  46.61 
 
 
407 aa  276  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  48.03 
 
 
405 aa  276  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  48.81 
 
 
401 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  48.31 
 
 
403 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  46.58 
 
 
409 aa  271  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.81 
 
 
411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.81 
 
 
411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1773  chromate transporter  48.98 
 
 
426 aa  267  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0287413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  48.3 
 
 
404 aa  264  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3452  hypothetical protein  50.66 
 
 
405 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758612  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  46.31 
 
 
398 aa  261  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  51.03 
 
 
392 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  50.38 
 
 
392 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  52.51 
 
 
404 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  46.38 
 
 
346 aa  255  7e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  44.22 
 
 
412 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  41.34 
 
 
383 aa  249  8e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0120  chromate transporter  49.61 
 
 
387 aa  248  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.320143  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  51.3 
 
 
407 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1287  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50.13 
 
 
411 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  39.74 
 
 
383 aa  227  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  42.97 
 
 
390 aa  226  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  40.73 
 
 
378 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  40.36 
 
 
387 aa  219  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  38.48 
 
 
395 aa  219  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  41.87 
 
 
380 aa  219  7e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  37.03 
 
 
383 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1023  chromate transporter  48.31 
 
 
398 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  41.43 
 
 
383 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  40.78 
 
 
390 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  39.95 
 
 
386 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  41.19 
 
 
418 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.93 
 
 
418 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  38.23 
 
 
392 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1930  chromate transporter  49.85 
 
 
330 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548978  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  43.24 
 
 
390 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  40.67 
 
 
418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  40.93 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  42.32 
 
 
390 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  41.56 
 
 
379 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  41.78 
 
 
390 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  37.5 
 
 
404 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  42.35 
 
 
402 aa  201  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  40.25 
 
 
381 aa  192  7e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1209  chromate transporter  45.27 
 
 
416 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  32.83 
 
 
493 aa  161  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  60.13 
 
 
443 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  54.14 
 
 
158 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89366  CHR family transporter: chromate ion  30.81 
 
 
476 aa  139  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0609883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2707  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.32 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  61.94 
 
 
407 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  30.79 
 
 
389 aa  130  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1603  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.38 
 
 
400 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.312378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>