More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4615 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 		 408 aa  779    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 		 408 aa  779    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  67.81 
 
 		 412 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  73.8 
 
 		 411 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  73.8 
 
 		 411 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  56.46 
 
 		 430 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  63.26 
 
 		 412 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  58.19 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  56.02 
 
 		 407 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  55.56 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  55.56 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  52.76 
 
 		 401 aa  358  8e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  54.76 
 
 		 401 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  54.76 
 
 		 401 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  54.76 
 
 		 401 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  49.63 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  57.03 
 
 		 413 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  55.35 
 
 		 388 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  56.59 
 
 		 403 aa  352  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  54.02 
 
 		 405 aa  351  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  54.41 
 
 		 404 aa  349  5e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  50.62 
 
 		 402 aa  349  5e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  53.58 
 
 		 425 aa  348  9e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  53.85 
 
 		 403 aa  345  6e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  53.3 
 
 		 396 aa  344  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  54.32 
 
 		 403 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  54.76 
 
 		 401 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  54.5 
 
 		 401 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.15 
 
 		 391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  53.2 
 
 		 408 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  53.09 
 
 		 403 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.39 
 
 		 403 aa  334  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  55.41 
 
 		 411 aa  333  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  47.04 
 
 		 393 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  53.09 
 
 		 403 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1773  chromate transporter  57.79 
 
 		 426 aa  328  9e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0287413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  49.38 
 
 		 393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  54.25 
 
 		 405 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  53.21 
 
 		 430 aa  326  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  49.76 
 
 		 409 aa  324  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  51.99 
 
 		 417 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  51.28 
 
 		 401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  53.08 
 
 		 404 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  52.41 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  52.81 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  52.03 
 
 		 398 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  48.48 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1287  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  60.99 
 
 		 411 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  49.49 
 
 		 393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  51.52 
 
 		 401 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  46.55 
 
 		 393 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  48.21 
 
 		 393 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  48.21 
 
 		 393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  47.95 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  47.95 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  48.46 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4856  putative transporter  53.2 
 
 		 401 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  52.42 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  48.34 
 
 		 394 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  51.65 
 
 		 392 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1023  chromate transporter  59.02 
 
 		 398 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1101  chromate transporter  46.8 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  47.63 
 
 		 346 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  52.66 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  45.78 
 
 		 378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  52.15 
 
 		 407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  52.61 
 
 		 404 aa  270  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  43.48 
 
 		 395 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  44.5 
 
 		 383 aa  263  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  41.75 
 
 		 383 aa  259  6e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0120  chromate transporter  50.7 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.320143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  43.8 
 
 		 383 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  43.88 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  42.09 
 
 		 390 aa  252  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  42.93 
 
 		 390 aa  249  8e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  44.99 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  43.5 
 
 		 390 aa  242  9e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  44.44 
 
 		 383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  41.79 
 
 		 379 aa  240  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  45.29 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1930  chromate transporter  50.46 
 
 		 330 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548978  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  43.29 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  41.69 
 
 		 380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  41.06 
 
 		 392 aa  230  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.6 
 
 		 418 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  42.35 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  42.09 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  42.35 
 
 		 382 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  38.69 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  42.82 
 
 		 402 aa  212  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  44.27 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1209  chromate transporter  45.79 
 
 		 416 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  60.62 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  31.72 
 
 		 493 aa  178  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3452  hypothetical protein  69.12 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758612  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.73 
 
 		 386 aa  159  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  55.48 
 
 		 158 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  32.32 
 
 		 389 aa  153  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.92 
 
 		 379 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.89 
 
 		 404 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>