More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3884 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  100 
 
 		 387 aa  747    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  56.53 
 
 		 383 aa  378  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  54.71 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  51.92 
 
 		 395 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  53.68 
 
 		 390 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  52.21 
 
 		 383 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  52.58 
 
 		 383 aa  344  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  53.07 
 
 		 378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  54.52 
 
 		 379 aa  342  8e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  51.04 
 
 		 386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.35 
 
 		 418 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  53.35 
 
 		 418 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  52.84 
 
 		 418 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  53.85 
 
 		 382 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  53.35 
 
 		 390 aa  328  7e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  51.8 
 
 		 390 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  54.42 
 
 		 380 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  52.3 
 
 		 390 aa  322  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  52.69 
 
 		 390 aa  319  5e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  52.36 
 
 		 381 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  50.38 
 
 		 402 aa  298  9e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  45.78 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  44.94 
 
 		 401 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  42.21 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  46.38 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  45.78 
 
 		 415 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  46.34 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  45.55 
 
 		 412 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  43.73 
 
 		 408 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  46.33 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  43.94 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  43.94 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  43.94 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  45.83 
 
 		 413 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.75 
 
 		 407 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  43.67 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  43.37 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  43.26 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.13 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  46.63 
 
 		 430 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  43.37 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  45.03 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  43.23 
 
 		 403 aa  242  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  41.95 
 
 		 430 aa  242  9e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  41.27 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  44.85 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  43.78 
 
 		 411 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.32 
 
 		 405 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4856  putative transporter  45.5 
 
 		 401 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  46.15 
 
 		 401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  42.27 
 
 		 393 aa  232  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.29 
 
 		 408 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.29 
 
 		 408 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  44.87 
 
 		 408 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  43.25 
 
 		 409 aa  229  6e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  42.38 
 
 		 393 aa  229  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  42.66 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  43.37 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  43.96 
 
 		 403 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  41.83 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  42.11 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  41.83 
 
 		 393 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  43.44 
 
 		 403 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  44.54 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  44.54 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  41.55 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  46.04 
 
 		 412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  40.91 
 
 		 394 aa  222  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  42.38 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  43.27 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.5 
 
 		 411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.5 
 
 		 411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.09 
 
 		 400 aa  219  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  43.75 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  41.42 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  39.4 
 
 		 392 aa  216  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  43.85 
 
 		 404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  44.62 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.6 
 
 		 403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1101  chromate transporter  40.36 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  43.52 
 
 		 392 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  39.1 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  44.95 
 
 		 346 aa  209  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.08 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0120  chromate transporter  44.72 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.320143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1773  chromate transporter  43.03 
 
 		 426 aa  203  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0287413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  42.78 
 
 		 407 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1023  chromate transporter  45.24 
 
 		 398 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1287  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.05 
 
 		 411 aa  195  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.35 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89366  CHR family transporter: chromate ion  30.61 
 
 		 476 aa  160  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0609883 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  31.55 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1930  chromate transporter  40.31 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548978  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03341  chromate ion transporter (Eurofung)  30 
 
 		 510 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.156083  normal  0.912193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1209  chromate transporter  43.73 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.85 
 
 		 404 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.58 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50.66 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3423  chromate transporter, permease component  29.62 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  32.45 
 
 		 393 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>