190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0980 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  357  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  81.71 
 
 		 176 aa  297  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  81.14 
 
 		 176 aa  295  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  63.75 
 
 		 176 aa  197  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  55.62 
 
 		 176 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  42.86 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  42.31 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  42.01 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  38.69 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  42.11 
 
 		 176 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  37.89 
 
 		 175 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  37.89 
 
 		 175 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  37.89 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  37.27 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  37.27 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  37.27 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  36.65 
 
 		 175 aa  121  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  40.49 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  39.16 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  40.66 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  36.47 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  39.18 
 
 		 179 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  37.87 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  41.95 
 
 		 202 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  32.2 
 
 		 180 aa  110  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  37.89 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  43.14 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  36.94 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  42.86 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  39.33 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  37.74 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  33.33 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  33.33 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  33.33 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  33.33 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  33.33 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  33.33 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  32.72 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  37.74 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  39.64 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  34.97 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  40.51 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  37.11 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  40.94 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  41.86 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  36.2 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  41.86 
 
 		 200 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  41.5 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  33.54 
 
 		 177 aa  91.3  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2205  CHR transporter  49.19 
 
 		 168 aa  89.4  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  34.01 
 
 		 175 aa  87  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  30 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  35.62 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  33.74 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  25 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  33.95 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  27.43 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  32.93 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  25.3 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  22.7 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  23.17 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  23.46 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  32.08 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  23.21 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  22.22 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  26.35 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  23.93 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  24.26 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  28.69 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  24.85 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  25.44 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1743  chromate transport protein  28.11 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  27.87 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  22.99 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  30.56 
 
 		 376 aa  57.8  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  26.74 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  31.91 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  36.96 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  22.73 
 
 		 416 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  30.53 
 
 		 383 aa  54.7  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2508  chromate transport protein  29.28 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.94 
 
 		 379 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  28.18 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  25.17 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  26.09 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2214  chromate transporter  28.73 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.707988  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  34.83 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  39.02 
 
 		 202 aa  52  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  39.02 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.44 
 
 		 472 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0104  Chromate transporter  26.49 
 
 		 186 aa  51.6  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000372126  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  27.7 
 
 		 390 aa  51.2  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.26 
 
 		 472 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  37.8 
 
 		 201 aa  50.8  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0955  chromate transporter  30.89 
 
 		 171 aa  51.2  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.457444  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  27.04 
 
 		 392 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  26.59 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  27.67 
 
 		 392 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  30.83 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.17 
 
 		 404 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>