More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3385 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  100 
 
 
172 aa  335  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  43.48 
 
 
175 aa  140  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  41.07 
 
 
173 aa  138  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  41.36 
 
 
175 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  40.74 
 
 
175 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  41.36 
 
 
175 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  40.74 
 
 
175 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  41.36 
 
 
175 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  41.36 
 
 
175 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  42.26 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  41.5 
 
 
176 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  41.07 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  39.05 
 
 
176 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  40.36 
 
 
173 aa  127  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  41.5 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  42.31 
 
 
176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  39.88 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  42.07 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  39.64 
 
 
176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  40.14 
 
 
176 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  40.14 
 
 
176 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  40.14 
 
 
176 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  40.14 
 
 
176 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  40.14 
 
 
176 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  40.14 
 
 
176 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  39.16 
 
 
181 aa  121  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  37.43 
 
 
177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  39.62 
 
 
176 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  38.51 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  38.67 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  38.67 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  36.65 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  39.63 
 
 
176 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  38.67 
 
 
194 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  39.75 
 
 
177 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  38.61 
 
 
174 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  39.33 
 
 
180 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  39.33 
 
 
180 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  36.94 
 
 
178 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  41.52 
 
 
212 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  41.95 
 
 
182 aa  101  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  41.83 
 
 
170 aa  100  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  38.92 
 
 
179 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  35.67 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  36.2 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  43.59 
 
 
175 aa  94  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  36.18 
 
 
198 aa  94  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  36.47 
 
 
202 aa  89.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  35.44 
 
 
202 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  33.96 
 
 
202 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  36.94 
 
 
200 aa  86.3  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  29.41 
 
 
172 aa  85.1  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  29.09 
 
 
416 aa  84.7  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  36.31 
 
 
200 aa  85.1  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  35.8 
 
 
174 aa  84.7  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2205  CHR transporter  43.95 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  27.59 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  27.88 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  30.26 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  35.14 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  30 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  31.85 
 
 
192 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  30.54 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  31.85 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  32.52 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  28.85 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  31.01 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  29.61 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  30.38 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  28.24 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  31.9 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.38 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.36 
 
 
395 aa  65.1  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  26.67 
 
 
393 aa  65.1  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  26.75 
 
 
184 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0955  chromate transporter  32.67 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.457444  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  31.93 
 
 
394 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  33.93 
 
 
390 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  36.36 
 
 
450 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  32.74 
 
 
392 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  32.74 
 
 
392 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  26.72 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  36.63 
 
 
395 aa  62  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.86 
 
 
472 aa  61.6  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.71 
 
 
415 aa  61.6  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.51 
 
 
387 aa  61.6  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  34.26 
 
 
390 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  34.26 
 
 
390 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  30.11 
 
 
187 aa  61.2  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  27.38 
 
 
174 aa  61.2  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  33.93 
 
 
390 aa  61.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  36.96 
 
 
418 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.31 
 
 
404 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  36.96 
 
 
382 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.86 
 
 
472 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  30.88 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.96 
 
 
418 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  30.88 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.27 
 
 
387 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  35.87 
 
 
383 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>