More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0460 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  100 
 
 		 180 aa  345  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  99.44 
 
 		 180 aa  343  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  98.33 
 
 		 180 aa  341  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  94.94 
 
 		 179 aa  307  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  87.64 
 
 		 179 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  65.54 
 
 		 200 aa  225  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  51.06 
 
 		 178 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  51.49 
 
 		 178 aa  140  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  40.74 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  40.12 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  40.12 
 
 		 175 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  40.12 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  40.12 
 
 		 175 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  40.12 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  40.12 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  37.97 
 
 		 173 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  39.74 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  38.82 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  37.97 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  39.87 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  37.82 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  37.82 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  37.82 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  37.82 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  37.82 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  37.82 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  40.59 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  37.18 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  36.42 
 
 		 175 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  36.02 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  35.4 
 
 		 176 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  34.59 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  40.99 
 
 		 177 aa  104  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  40.36 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  41.89 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  35.95 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  37.8 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  36.16 
 
 		 194 aa  94.4  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  37.14 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  32.52 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  30.91 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  35.48 
 
 		 179 aa  88.2  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  32.1 
 
 		 172 aa  87.4  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  31.1 
 
 		 416 aa  86.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  31.9 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  39.45 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  31.09 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  28.67 
 
 		 420 aa  77.8  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  29.3 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  32.28 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  27.16 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  32.48 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  31.21 
 
 		 202 aa  72  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  28.57 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.71 
 
 		 472 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  27.5 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.5 
 
 		 472 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  33.81 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0955  chromate transporter  36.73 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.457444  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  30.32 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  30.32 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  27.59 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  28.76 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  28.92 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  28.03 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  30.32 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  26.02 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  30.77 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  30.33 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  31.93 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  30.89 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  30.08 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3423  chromate transporter, permease component  28.85 
 
 		 400 aa  62  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  26.88 
 
 		 393 aa  61.6  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  28.98 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  25.45 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  30.65 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.16 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1603  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.79 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.312378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  33.04 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  36.59 
 
 		 399 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  29.68 
 
 		 379 aa  58.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  28.85 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  37.21 
 
 		 383 aa  58.2  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  25.16 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.73 
 
 		 387 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  29.41 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.26 
 
 		 395 aa  57.8  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  23.08 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11551  chromate transporter  28.85 
 
 		 412 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0167365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.68 
 
 		 391 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  34.13 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.89 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0466  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.24 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  34.85 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2707  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.71 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0443  chromate transporter  28.3 
 
 		 412 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0471  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.24 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.93 
 
 		 441 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  36.94 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>