More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6792 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  100 
 
 
176 aa  345  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  92.05 
 
 
176 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  80 
 
 
175 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  79.43 
 
 
175 aa  290  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  78.29 
 
 
175 aa  290  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  77.71 
 
 
175 aa  288  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  78.29 
 
 
175 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  77.71 
 
 
175 aa  286  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  77.71 
 
 
175 aa  286  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  79.75 
 
 
176 aa  262  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  73.42 
 
 
176 aa  247  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  73.42 
 
 
176 aa  246  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  73.42 
 
 
176 aa  246  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  73.42 
 
 
176 aa  246  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  73.42 
 
 
176 aa  246  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  73.42 
 
 
176 aa  246  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  73.42 
 
 
176 aa  246  9e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  69.01 
 
 
173 aa  236  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  65.32 
 
 
173 aa  229  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  39.64 
 
 
172 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  40.36 
 
 
200 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  37.79 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  43.37 
 
 
179 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  38.01 
 
 
178 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  41.76 
 
 
176 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  37.79 
 
 
179 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  47.86 
 
 
170 aa  121  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  37.89 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  42.38 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  38.6 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  40.4 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  37.27 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  36.65 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  41.06 
 
 
180 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  37.42 
 
 
177 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  40.4 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  37.57 
 
 
174 aa  110  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  39.38 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  38.37 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  34.88 
 
 
180 aa  104  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  36.63 
 
 
194 aa  99  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  35.1 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  37.82 
 
 
175 aa  88.6  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  28.75 
 
 
420 aa  84.7  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  33.91 
 
 
182 aa  84.3  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  33.33 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  33.54 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  33.08 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  36.24 
 
 
199 aa  80.9  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  34.62 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  29.14 
 
 
183 aa  77.4  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  32.82 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  31.36 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  31.5 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  31.58 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  28.32 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  31.21 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  26.35 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  29.11 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0955  chromate transporter  35.16 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.457444  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  22.98 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  22.02 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  31.41 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  30.13 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  30.77 
 
 
392 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  30.77 
 
 
394 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2841  Chromate transporter  28.03 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000452935  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.14 
 
 
415 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.35 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2341  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.96 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  30 
 
 
392 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  29.17 
 
 
397 aa  65.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.84 
 
 
472 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  24.18 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  25.75 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  27.06 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  29.05 
 
 
396 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  29.05 
 
 
396 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.97 
 
 
472 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  29.55 
 
 
396 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  29.05 
 
 
396 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.1 
 
 
404 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  21.76 
 
 
199 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  28.38 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  23.78 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  28.38 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  25.75 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  28.97 
 
 
193 aa  62.4  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.71 
 
 
390 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  34.34 
 
 
401 aa  62  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.44 
 
 
387 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  36.13 
 
 
430 aa  62  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  39.56 
 
 
450 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  29.75 
 
 
382 aa  61.6  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  29.81 
 
 
193 aa  62  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  26.61 
 
 
185 aa  61.6  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  35.77 
 
 
209 aa  62  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 
390 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 
382 aa  60.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  29.79 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>