More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6228 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  100 
 
 		 200 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  68.42 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  70.7 
 
 		 179 aa  224  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  68.59 
 
 		 180 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  69.23 
 
 		 180 aa  214  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  68.59 
 
 		 180 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  44.38 
 
 		 178 aa  144  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  46.3 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  41.21 
 
 		 175 aa  134  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  41.94 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  41.21 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  41.21 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  41.21 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  41.21 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  40.61 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  40 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  39.39 
 
 		 176 aa  124  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  40.36 
 
 		 176 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  39.33 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  39.33 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  39.33 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  39.33 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  39.33 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  39.33 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  39.33 
 
 		 176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  42.07 
 
 		 173 aa  118  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  37.43 
 
 		 173 aa  118  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  43.27 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  34.91 
 
 		 177 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  34.44 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  35.58 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  45.99 
 
 		 170 aa  102  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  36.2 
 
 		 181 aa  101  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  36.65 
 
 		 172 aa  101  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  33.96 
 
 		 176 aa  95.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  35.26 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  32.7 
 
 		 176 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  38.6 
 
 		 176 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  33.54 
 
 		 174 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  31.65 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  36.18 
 
 		 167 aa  89  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  35.42 
 
 		 174 aa  89.4  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  35.77 
 
 		 420 aa  87.8  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  31.37 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  35.44 
 
 		 179 aa  85.5  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  35.77 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  40.37 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  31.46 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  28.83 
 
 		 416 aa  81.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  28.32 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.49 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  31.97 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  29.01 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.14 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  27.54 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  31.34 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  27.91 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  29.41 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.57 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0955  chromate transporter  36.77 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.457444  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  31.03 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.46 
 
 		 472 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  31.29 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  26.09 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  30.07 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  30.46 
 
 		 493 aa  68.6  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  26.28 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  32.26 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  32.26 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.49 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  35.11 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  30.77 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.46 
 
 		 472 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  32.97 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  24.56 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  34.13 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  30.41 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  33.86 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.62 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  28.68 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  24.22 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  29.63 
 
 		 376 aa  61.6  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.36 
 
 		 441 aa  61.6  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  29.3 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  30.89 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.03 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  32.52 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.52 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.5 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  28.3 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  28.16 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  29.08 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2707  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.79 
 
 		 395 aa  59.3  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  33.85 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  28.9 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  30.65 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  29.29 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  26.98 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  29.45 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  30.89 
 
 		 393 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>