More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2328 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  100 
 
 
173 aa  331  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  69.41 
 
 
175 aa  237  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  69.41 
 
 
175 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  69.41 
 
 
175 aa  235  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  69.41 
 
 
175 aa  234  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  68.82 
 
 
175 aa  234  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  68.82 
 
 
175 aa  234  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  68.24 
 
 
175 aa  233  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  70.89 
 
 
176 aa  224  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  69.41 
 
 
176 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  64.33 
 
 
173 aa  219  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  69.01 
 
 
176 aa  215  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  68.99 
 
 
176 aa  214  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  67.72 
 
 
176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  67.72 
 
 
176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  67.72 
 
 
176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  67.72 
 
 
176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  67.72 
 
 
176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  67.72 
 
 
176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  40.94 
 
 
172 aa  128  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  39.51 
 
 
175 aa  123  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  40.74 
 
 
179 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  41.21 
 
 
177 aa  120  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  46.94 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  38.01 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  41.14 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  42.07 
 
 
200 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  35.29 
 
 
178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  36.47 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  39.35 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  38.78 
 
 
179 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  37.34 
 
 
176 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  36.71 
 
 
176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  42.42 
 
 
176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  37.41 
 
 
180 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  38.1 
 
 
180 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  40.76 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  37.41 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  37.74 
 
 
177 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  38.71 
 
 
176 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  35.67 
 
 
180 aa  100  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  40.35 
 
 
182 aa  97.4  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  34.5 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  35.14 
 
 
199 aa  87.4  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  38.66 
 
 
175 aa  87.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  31.9 
 
 
194 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  28.12 
 
 
420 aa  85.9  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  30.18 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  27.98 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  33.33 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  25.44 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  27.5 
 
 
181 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  30.88 
 
 
394 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  30.08 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  25.44 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0955  chromate transporter  34.62 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.457444  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  29.05 
 
 
396 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  29.82 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  28.07 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  26.83 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  30.57 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  28.86 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  28.86 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.52 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  31.14 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  28.86 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  27.81 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  28.38 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  28.38 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  27.63 
 
 
198 aa  72  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  29.82 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  25.86 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  29.76 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2841  Chromate transporter  31.21 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000452935  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  27.22 
 
 
202 aa  70.9  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  25.15 
 
 
393 aa  70.9  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  27.22 
 
 
392 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  29.92 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.3 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  25.79 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.12 
 
 
472 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  30.77 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  24.26 
 
 
416 aa  68.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.75 
 
 
472 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  29.49 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  27.5 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  27.49 
 
 
390 aa  68.2  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  23.12 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  25 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  22.29 
 
 
387 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  28.19 
 
 
393 aa  67  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.41 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  22.42 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  31.78 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2341  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.87 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  24.18 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2205  CHR transporter  35.95 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  29.94 
 
 
390 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  29.94 
 
 
390 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  29.94 
 
 
390 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>