270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2354 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  100 
 
 
176 aa  340  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  71.88 
 
 
176 aa  243  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  62.64 
 
 
181 aa  207  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  60.92 
 
 
176 aa  205  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  60.34 
 
 
176 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  46.02 
 
 
176 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  43.02 
 
 
172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  43.59 
 
 
176 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  39.88 
 
 
177 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  43.53 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  41.14 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  39.29 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  38.32 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  37.99 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  40.48 
 
 
175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  39.05 
 
 
175 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  39.77 
 
 
194 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  37.43 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  39.05 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  37.43 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  39.41 
 
 
194 aa  114  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  40.78 
 
 
182 aa  114  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  37.87 
 
 
175 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  38.75 
 
 
173 aa  114  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  36.48 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  39.18 
 
 
176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  41.62 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  35.85 
 
 
180 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  35.62 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  39.43 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  40.94 
 
 
202 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  39.49 
 
 
202 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  39.22 
 
 
198 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  39.87 
 
 
200 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  39.87 
 
 
200 aa  104  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  35.22 
 
 
180 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  34.38 
 
 
176 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  34.38 
 
 
176 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  34.38 
 
 
176 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  34.38 
 
 
176 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  34.38 
 
 
176 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  34.38 
 
 
176 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  34.59 
 
 
180 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  40.51 
 
 
202 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  33.91 
 
 
180 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  37.5 
 
 
175 aa  101  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  34.15 
 
 
176 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  36.21 
 
 
177 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  35.03 
 
 
175 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  40.13 
 
 
170 aa  92  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  31.33 
 
 
178 aa  91.3  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  28.31 
 
 
420 aa  87  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  37.82 
 
 
178 aa  84.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  37.86 
 
 
199 aa  84  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2205  CHR transporter  42.24 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  28.92 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  24.55 
 
 
416 aa  71.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  25.88 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  27.11 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  34.48 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  27.22 
 
 
199 aa  64.3  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  39.34 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  22.42 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  35.71 
 
 
193 aa  62  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  31.68 
 
 
187 aa  62  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.99 
 
 
415 aa  61.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  23.03 
 
 
179 aa  61.2  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.27 
 
 
387 aa  61.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  30.28 
 
 
192 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  28.1 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  28.1 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.83 
 
 
387 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  30.22 
 
 
192 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  26.03 
 
 
154 aa  57.8  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  26.62 
 
 
174 aa  57.8  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  26.63 
 
 
187 aa  57.8  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  28.31 
 
 
167 aa  57.8  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  25.15 
 
 
171 aa  57.4  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  33.57 
 
 
193 aa  57.8  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  28.93 
 
 
195 aa  57  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  25 
 
 
393 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  27.92 
 
 
396 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  27.45 
 
 
396 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  33.6 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  32 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  33.12 
 
 
450 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  25.15 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  29.51 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  33.86 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  27.45 
 
 
396 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  31.62 
 
 
203 aa  55.5  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  27.45 
 
 
396 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  30.71 
 
 
376 aa  54.3  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  38.75 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  22.56 
 
 
173 aa  53.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  36.96 
 
 
361 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  32.95 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  24.84 
 
 
213 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  28.08 
 
 
392 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0955  chromate transporter  34.01 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.457444  normal  0.869968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>