230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1523 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  100 
 
 
174 aa  333  5.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  45.56 
 
 
179 aa  137  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  40.96 
 
 
176 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  40.36 
 
 
176 aa  130  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  42.31 
 
 
181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  40.83 
 
 
175 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  40.83 
 
 
175 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  40.83 
 
 
175 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  40.83 
 
 
175 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  40.83 
 
 
175 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  40.24 
 
 
175 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  40.83 
 
 
175 aa  117  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  41.96 
 
 
176 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  36.42 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  40.76 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  36.63 
 
 
176 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  38.61 
 
 
172 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  38.46 
 
 
176 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  38.64 
 
 
194 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  36.6 
 
 
179 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  34.81 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  34.81 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  34.81 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  37.57 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  34.81 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  34.81 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  34.81 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  34.97 
 
 
176 aa  98.6  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  42.15 
 
 
176 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  36.17 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  34.18 
 
 
176 aa  97.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  33.33 
 
 
177 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  35.46 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  42.59 
 
 
175 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  40.12 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  35.85 
 
 
177 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  35.06 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  39.13 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  39.53 
 
 
194 aa  91.3  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  39.13 
 
 
180 aa  90.9  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  43.44 
 
 
198 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  39.5 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  35.42 
 
 
200 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  34.13 
 
 
212 aa  88.2  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  38.81 
 
 
202 aa  87  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  36.94 
 
 
202 aa  87  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  36.54 
 
 
200 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  36.54 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  36.43 
 
 
202 aa  85.5  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  31.17 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  30.63 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  44.04 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  32.53 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.57 
 
 
379 aa  71.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.07 
 
 
404 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  25 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  30.65 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  29.75 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  30.71 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2205  CHR transporter  38.26 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.17 
 
 
415 aa  64.7  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  25.32 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  34.27 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  27.66 
 
 
393 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  35.59 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0955  chromate transporter  32.81 
 
 
171 aa  62  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.457444  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  33.87 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  28.23 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  24.7 
 
 
420 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.94 
 
 
387 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.25 
 
 
387 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  28.67 
 
 
392 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  29.88 
 
 
174 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2840  Chromate transporter  31.06 
 
 
180 aa  58.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127351  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  29.05 
 
 
376 aa  58.2  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  29.73 
 
 
196 aa  57.8  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 
395 aa  57.8  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.71 
 
 
472 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0647  chromate transporter  31.34 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  26.25 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  27.27 
 
 
392 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  29.17 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  35.14 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  28.47 
 
 
390 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  28.47 
 
 
390 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  28.47 
 
 
390 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  26.67 
 
 
385 aa  55.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  27.97 
 
 
183 aa  55.1  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  30.83 
 
 
203 aa  54.7  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.21 
 
 
472 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  25.96 
 
 
416 aa  54.3  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  23.08 
 
 
185 aa  54.3  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  45.45 
 
 
201 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  29.63 
 
 
383 aa  53.9  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  27.78 
 
 
397 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  37.68 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  27.91 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  29.89 
 
 
450 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.14 
 
 
393 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.57 
 
 
390 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>