More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1288 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  100 
 
 
174 aa  339  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  71.26 
 
 
174 aa  256  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  68.39 
 
 
174 aa  230  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  68.39 
 
 
174 aa  228  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  61.9 
 
 
167 aa  207  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  35.98 
 
 
172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  39.88 
 
 
171 aa  114  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  39.63 
 
 
416 aa  112  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  37.04 
 
 
379 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  35.33 
 
 
174 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  39.32 
 
 
420 aa  104  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  37.42 
 
 
393 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.02 
 
 
387 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.19 
 
 
472 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.41 
 
 
387 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.84 
 
 
472 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.52 
 
 
386 aa  101  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  34.36 
 
 
172 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  33.33 
 
 
183 aa  97.8  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  31.95 
 
 
189 aa  97.4  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 
404 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  33.33 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  33.33 
 
 
183 aa  95.5  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  33.14 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.12 
 
 
379 aa  92  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  37.1 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  32.52 
 
 
195 aa  92  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  37.29 
 
 
183 aa  90.5  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  33.76 
 
 
376 aa  90.5  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  36.78 
 
 
397 aa  89.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2707  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.11 
 
 
395 aa  89.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  38.58 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  30.82 
 
 
394 aa  89  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.42 
 
 
395 aa  89  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  32.89 
 
 
396 aa  88.6  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  33.54 
 
 
376 aa  88.6  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  30.82 
 
 
397 aa  88.6  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  30.82 
 
 
390 aa  88.6  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  34.15 
 
 
403 aa  88.6  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.17 
 
 
392 aa  88.6  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  36.64 
 
 
187 aa  88.2  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.14 
 
 
395 aa  87.4  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2341  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.8 
 
 
386 aa  87.4  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  37.11 
 
 
408 aa  87  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  37.65 
 
 
383 aa  87  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  32 
 
 
390 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  39.29 
 
 
418 aa  86.7  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  32 
 
 
390 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  32 
 
 
390 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  33.73 
 
 
177 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  32.53 
 
 
382 aa  85.9  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  35.98 
 
 
403 aa  85.5  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  29.56 
 
 
392 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  33.55 
 
 
401 aa  85.1  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 
391 aa  85.1  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  43.22 
 
 
428 aa  84.7  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  27.67 
 
 
175 aa  84.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  35.71 
 
 
192 aa  84.7  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  33.33 
 
 
396 aa  84.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  39.26 
 
 
389 aa  84.7  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  33.33 
 
 
396 aa  84.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  30.57 
 
 
376 aa  84.3  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  33.94 
 
 
176 aa  84.3  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.25 
 
 
352 aa  84.3  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  37.74 
 
 
409 aa  84.3  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  27.67 
 
 
175 aa  84.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  27.67 
 
 
175 aa  84.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  27.67 
 
 
175 aa  84.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  34.13 
 
 
396 aa  84  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  29.56 
 
 
392 aa  84  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  37.04 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  32.72 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  31.08 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  35.37 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  27.04 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  33.33 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  27.04 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  33.33 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  31.46 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  33.33 
 
 
393 aa  82.4  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  27.67 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.58 
 
 
390 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.58 
 
 
390 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  34.91 
 
 
401 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  35.11 
 
 
185 aa  82  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.46 
 
 
393 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  34.64 
 
 
393 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  39.46 
 
 
158 aa  82  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  33.99 
 
 
393 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  31.18 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  35.85 
 
 
408 aa  81.3  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  33.99 
 
 
393 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  34.15 
 
 
403 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  33.99 
 
 
393 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  33.99 
 
 
393 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  33.99 
 
 
393 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  33.99 
 
 
393 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  35.37 
 
 
408 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  33.99 
 
 
393 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0104  Chromate transporter  31.61 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000372126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>