180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2214 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  100 
 
 		 202 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  60.61 
 
 		 194 aa  234  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  60.77 
 
 		 194 aa  222  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  65.75 
 
 		 202 aa  222  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  62.7 
 
 		 202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  58.79 
 
 		 212 aa  201  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  61.08 
 
 		 198 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  59.68 
 
 		 200 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  59.68 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  57.05 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  43.92 
 
 		 182 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2205  CHR transporter  55.37 
 
 		 168 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  40.11 
 
 		 176 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  42.47 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  39.57 
 
 		 176 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  40.94 
 
 		 176 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  38.71 
 
 		 175 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  37.97 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  38.71 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  38.17 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  38.17 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  38.17 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  37.63 
 
 		 175 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  37.04 
 
 		 172 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  37.21 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  35.39 
 
 		 173 aa  101  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  36.21 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  33.69 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  35.48 
 
 		 176 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  36.46 
 
 		 179 aa  91.7  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  34.71 
 
 		 176 aa  92  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  37.1 
 
 		 176 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  36.26 
 
 		 176 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  31.38 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  34.71 
 
 		 176 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  34.71 
 
 		 176 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  34.71 
 
 		 176 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  34.71 
 
 		 176 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  34.71 
 
 		 176 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  34.71 
 
 		 176 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  33.69 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  31.87 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  32.02 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  35.51 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  30.41 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  30.77 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  32.31 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  34.51 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  31.21 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  31.79 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  31.82 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  31.21 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  29.71 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  31.01 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  35.37 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.75 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  25 
 
 		 408 aa  65.1  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  26.06 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  32.11 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  28.65 
 
 		 167 aa  62  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  24.63 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.06 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  30.15 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  22.78 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  25.36 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  30.77 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  30.77 
 
 		 392 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.58 
 
 		 392 aa  58.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  25 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  22.67 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  22.76 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  18.28 
 
 		 420 aa  55.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.26 
 
 		 441 aa  55.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  28.29 
 
 		 396 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  30 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  28.29 
 
 		 396 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  28.29 
 
 		 396 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  32.48 
 
 		 382 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.54 
 
 		 387 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  24.87 
 
 		 393 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  29.2 
 
 		 388 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  29.75 
 
 		 394 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  30 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  30 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0443  chromate transporter  27.86 
 
 		 412 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  28.37 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11551  chromate transporter  27.86 
 
 		 412 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0167365 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  23.86 
 
 		 174 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  23.53 
 
 		 172 aa  52  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  31.97 
 
 		 401 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  27.66 
 
 		 174 aa  51.6  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  22.78 
 
 		 173 aa  51.2  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.43 
 
 		 382 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25 
 
 		 387 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1209  chromate transporter  38.33 
 
 		 416 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  26.85 
 
 		 397 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  27.97 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  27.89 
 
 		 428 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  33.58 
 
 		 401 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  32.85 
 
 		 411 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>