221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2205 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2205  CHR transporter  100 
 
 		 168 aa  319  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  52.25 
 
 		 194 aa  167  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  56.4 
 
 		 202 aa  160  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  57.31 
 
 		 182 aa  158  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  56.57 
 
 		 202 aa  157  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  50.31 
 
 		 194 aa  154  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  50.98 
 
 		 198 aa  140  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  48.82 
 
 		 212 aa  140  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  49.68 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  46.11 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  49.13 
 
 		 200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  46.99 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  48.55 
 
 		 200 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  44.91 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  47.83 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  44.25 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  42.38 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  42.31 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  38.79 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  40.61 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  40 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  40 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  40 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  39.39 
 
 		 175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  39.39 
 
 		 175 aa  97.1  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  39.76 
 
 		 175 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  39.26 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  38.27 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  40 
 
 		 176 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  39.64 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  36.31 
 
 		 175 aa  87.8  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  37.18 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  29.17 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  36.2 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  35.81 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  36.14 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  33.33 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  36.75 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  36.77 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  36.36 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  37.33 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  30.57 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  35.71 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  37.33 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  37.33 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  37.33 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  37.33 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  37.33 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  35.06 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  33.77 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  32.92 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  38.89 
 
 		 383 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  26.35 
 
 		 420 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.71 
 
 		 387 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  37.16 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.67 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  26.95 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  32.93 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  31.45 
 
 		 392 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  41.75 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  31.45 
 
 		 392 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  34.11 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  25.79 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  28.14 
 
 		 393 aa  61.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  28.95 
 
 		 394 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  28.93 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  36.92 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  36.11 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  30.59 
 
 		 393 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  28.49 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  28.97 
 
 		 396 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.48 
 
 		 404 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  30.56 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  30.56 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1743  chromate transport protein  25.54 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.45 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.14 
 
 		 472 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  28.4 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  29.66 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  25.79 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  29.66 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  28.66 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.71 
 
 		 472 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.33 
 
 		 395 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  29.66 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.25 
 
 		 390 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  31.65 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  29.88 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  26.45 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  25.64 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  31.58 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1753  Chromate transporter  36.36 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  27.74 
 
 		 376 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.21 
 
 		 390 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  27.39 
 
 		 397 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  29.11 
 
 		 390 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  33.57 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  28.1 
 
 		 388 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.08 
 
 		 379 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.06 
 
 		 392 aa  53.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>