More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2052 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  100 
 
 
178 aa  348  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  90.96 
 
 
178 aa  323  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  46.88 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  51.43 
 
 
179 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  49.67 
 
 
179 aa  141  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  51.49 
 
 
180 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  50 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  50.75 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  38.24 
 
 
175 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  38.24 
 
 
175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  42 
 
 
176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  38.95 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  38.95 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  38.95 
 
 
175 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  38.95 
 
 
175 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  38.01 
 
 
173 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  37.65 
 
 
175 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  37.72 
 
 
173 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  37.65 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  38.82 
 
 
176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  38.6 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  38.16 
 
 
176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  38.16 
 
 
176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  38.16 
 
 
176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  38.16 
 
 
176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  38.16 
 
 
176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  38.16 
 
 
176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  33.91 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  30.11 
 
 
175 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  35.67 
 
 
172 aa  97.8  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  37.01 
 
 
174 aa  95.5  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  37.41 
 
 
175 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  32.03 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  31.58 
 
 
172 aa  84.7  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  34.09 
 
 
194 aa  84.3  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  33.93 
 
 
177 aa  84.3  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  30.57 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  29.94 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  33.13 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  38.02 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  31.01 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  30.91 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  28.57 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  31.55 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  29.34 
 
 
416 aa  76.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  34.06 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  31.29 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  30.34 
 
 
420 aa  75.9  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  27.87 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  28.97 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  28.95 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  32.96 
 
 
202 aa  74.3  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  31.9 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  29.11 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  28.48 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  35.54 
 
 
192 aa  72  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  28.95 
 
 
176 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0955  chromate transporter  34.35 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.457444  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  33.81 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  29.11 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  31.45 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  25.43 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  35.96 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  24.86 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  29.45 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  32.69 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  29.94 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  29.94 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  32.39 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  26.67 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  26.59 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  37 
 
 
399 aa  65.1  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  27.59 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.61 
 
 
415 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  34.48 
 
 
393 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  29.94 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  28.3 
 
 
184 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  25 
 
 
493 aa  62.4  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  29.24 
 
 
174 aa  61.6  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  28.93 
 
 
202 aa  61.2  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0344  hypothetical protein  29.33 
 
 
177 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  26.04 
 
 
408 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.38 
 
 
382 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  24.5 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  33.33 
 
 
158 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  29.24 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3452  hypothetical protein  31.97 
 
 
405 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758612  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2341  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.32 
 
 
386 aa  58.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2841  Chromate transporter  31.25 
 
 
173 aa  58.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000452935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  24.57 
 
 
183 aa  58.2  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  28.35 
 
 
428 aa  58.2  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  24.39 
 
 
203 aa  58.2  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  31.47 
 
 
408 aa  58.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.66 
 
 
472 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  29.38 
 
 
450 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0369  hypothetical protein  32.08 
 
 
177 aa  57.8  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  24.11 
 
 
187 aa  57.8  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  24.57 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  31.58 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.47 
 
 
472 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>