283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0955 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0955  chromate transporter  100 
 
 
171 aa  325  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.457444  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  37.42 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  35.85 
 
 
175 aa  97.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  37.34 
 
 
200 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  35.22 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  34.76 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  34.76 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  34.18 
 
 
175 aa  94.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  37.35 
 
 
177 aa  94.7  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  33.96 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  34.59 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  34.59 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  33.73 
 
 
178 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  32.52 
 
 
173 aa  92.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  34.97 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  35.94 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  33.77 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  33.77 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  35 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  33.77 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  33.77 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  33.77 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  33.77 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  33.13 
 
 
178 aa  84.3  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  35.62 
 
 
179 aa  84.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  34.44 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  36.42 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  35.76 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  38.32 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.14 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  33.56 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  41.59 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0054  Chromate transporter  45.89 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.98 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  31.33 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.33 
 
 
391 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  30.67 
 
 
393 aa  75.9  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  37.62 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  32.81 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  27.78 
 
 
397 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  30.54 
 
 
176 aa  73.9  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  34.01 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  30.82 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  30.82 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  34.9 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  31.25 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  32.67 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  37.65 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  32.12 
 
 
390 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  32.12 
 
 
390 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  32.12 
 
 
390 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  31.06 
 
 
394 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  38.18 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.36 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  36.6 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  29.94 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  35.85 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  27.81 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.74 
 
 
404 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  32.75 
 
 
389 aa  69.3  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.42 
 
 
393 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  30.14 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  30.14 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  33.54 
 
 
174 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  30.49 
 
 
390 aa  67.4  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  31.29 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  28.57 
 
 
396 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  29.45 
 
 
396 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  29.45 
 
 
396 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  29.45 
 
 
396 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  24.86 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  31.74 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  31.1 
 
 
379 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  31.14 
 
 
382 aa  62.4  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.85 
 
 
379 aa  62  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  31.65 
 
 
202 aa  62  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  31.62 
 
 
176 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  28.57 
 
 
376 aa  62  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  24.24 
 
 
393 aa  61.6  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  30 
 
 
190 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  24.42 
 
 
385 aa  61.6  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  22.89 
 
 
172 aa  61.2  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  30.39 
 
 
194 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  37.61 
 
 
175 aa  60.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.91 
 
 
390 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.91 
 
 
390 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  26.51 
 
 
416 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  39.56 
 
 
202 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.39 
 
 
395 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  28.65 
 
 
195 aa  59.7  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  34.29 
 
 
193 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  31.76 
 
 
185 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  32.08 
 
 
212 aa  58.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  27.86 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  28.47 
 
 
190 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  28.74 
 
 
194 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  39.08 
 
 
203 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  39.08 
 
 
203 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  39.08 
 
 
203 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  37.93 
 
 
203 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>