176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0533 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  100 
 
 		 179 aa  342  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  43.02 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  43.6 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  47.34 
 
 		 176 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  41.86 
 
 		 175 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  45.56 
 
 		 174 aa  137  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  41.86 
 
 		 175 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  41.28 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  41.28 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  41.28 
 
 		 175 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  42.01 
 
 		 181 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  43.67 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  39.76 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  39.87 
 
 		 176 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  39.41 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  39.87 
 
 		 176 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  39.87 
 
 		 176 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  39.87 
 
 		 176 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  39.87 
 
 		 176 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  39.87 
 
 		 176 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  39.87 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  41.14 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  38.55 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  42.86 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  44.16 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  40 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  37.79 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  42.5 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  38.92 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  35.71 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  36.31 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  35.56 
 
 		 194 aa  90.1  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  34.78 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  34.39 
 
 		 176 aa  89  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  37.74 
 
 		 177 aa  88.2  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  34.93 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  34.93 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  34.93 
 
 		 180 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  35.44 
 
 		 200 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  34.25 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  44.2 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  36.08 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  33.12 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  36.08 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  34.64 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  39.23 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  34.32 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  37.86 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  33.75 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  34.39 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  34.39 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  37.5 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  30.3 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2205  CHR transporter  40.83 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  31.1 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  30.49 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  28.9 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  27.91 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  29.27 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  29.94 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.73 
 
 		 415 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0955  chromate transporter  37.9 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.457444  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  25.62 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  23.78 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  30.91 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  25.9 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  29.07 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  27.59 
 
 		 416 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  32 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  26.32 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  34.52 
 
 		 450 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  26.86 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  29.24 
 
 		 382 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.24 
 
 		 379 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  28.57 
 
 		 185 aa  50.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  29.69 
 
 		 394 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  25.37 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  29.37 
 
 		 392 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  29.14 
 
 		 376 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  42.68 
 
 		 392 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  28.91 
 
 		 396 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  27.27 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  29.37 
 
 		 392 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  42.86 
 
 		 411 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  28.91 
 
 		 401 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.82 
 
 		 386 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  21.95 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.16 
 
 		 392 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  28.91 
 
 		 396 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  31.86 
 
 		 383 aa  48.5  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  28.91 
 
 		 396 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  41.46 
 
 		 392 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  28.91 
 
 		 396 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.91 
 
 		 390 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  27.34 
 
 		 397 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  26.15 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0471  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.1 
 
 		 430 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.63 
 
 		 391 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0466  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.1 
 
 		 444 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  36.56 
 
 		 401 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>