More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2308 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  100 
 
 		 191 aa  374  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  81.68 
 
 		 201 aa  271  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  68.65 
 
 		 196 aa  236  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  61.5 
 
 		 203 aa  224  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  64.09 
 
 		 196 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  64.44 
 
 		 199 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  60.11 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  60.54 
 
 		 202 aa  207  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  59.67 
 
 		 198 aa  204  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  60.11 
 
 		 196 aa  198  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  57.93 
 
 		 209 aa  188  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  62.43 
 
 		 233 aa  177  9e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  43.3 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  42.86 
 
 		 185 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  40.64 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  40.11 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  39.55 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  43.2 
 
 		 178 aa  116  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  38.37 
 
 		 187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  42.2 
 
 		 193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  42.5 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  40.12 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  39.88 
 
 		 188 aa  98.2  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  36.97 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  36.02 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  38.37 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  35.48 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  42.02 
 
 		 361 aa  91.3  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  38.46 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  38.46 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  39.87 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  39.87 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  39.87 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  39.87 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  33.33 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  33.92 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  38.12 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  33.73 
 
 		 202 aa  84.7  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  37.21 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  36.25 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  30.81 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.14 
 
 		 392 aa  81.3  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  31.61 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  30.23 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  30.23 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  35.47 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  30.23 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  39.88 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  31.71 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  29.81 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  35 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  32.89 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  35 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  35 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  29.19 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  34.07 
 
 		 385 aa  74.3  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  30.68 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  38.94 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  34.31 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  34.26 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  29.34 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  27.13 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  30 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  26.28 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0053  Chromate transporter  38.61 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  34.27 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  33.33 
 
 		 394 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  31.4 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  30 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  29.03 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  36.3 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  26.34 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  30.56 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  29.03 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  30.3 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  31.2 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  28.97 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  28.97 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  30.36 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  29.48 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  28.97 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  28.97 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  28.47 
 
 		 396 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  28.97 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  28.67 
 
 		 420 aa  62.4  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.2 
 
 		 400 aa  62  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  30.83 
 
 		 392 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  30.83 
 
 		 392 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  29.58 
 
 		 401 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.23 
 
 		 395 aa  61.6  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  28.48 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.63 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.63 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  27.78 
 
 		 447 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.79 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  29.85 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  32.46 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  31.13 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.38 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>