More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6104 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  100 
 
 		 198 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  66.47 
 
 		 198 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  43.35 
 
 		 178 aa  140  9e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  44.13 
 
 		 187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  42.11 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  46.02 
 
 		 193 aa  137  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  43.18 
 
 		 192 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  42.86 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  41.52 
 
 		 188 aa  118  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  40 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  43.33 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  42.71 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  40.45 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  40.64 
 
 		 191 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  39.01 
 
 		 209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  39.04 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  38.64 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  39.18 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  41.34 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  38.67 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  43.65 
 
 		 361 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  39.55 
 
 		 189 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  41.15 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  37.82 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  37.82 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  37.82 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  37.82 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  37.82 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  38.76 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  38.95 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  44.32 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  39.9 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  37.63 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  37.21 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  37.79 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  37.87 
 
 		 208 aa  101  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  38.37 
 
 		 226 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  38.37 
 
 		 226 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  38.37 
 
 		 226 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  40.24 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  38.61 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  35.93 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  41.67 
 
 		 188 aa  88.2  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  34.08 
 
 		 190 aa  87.8  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  35.14 
 
 		 199 aa  85.1  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  33.53 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  30.98 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  37.5 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  39.2 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.04 
 
 		 415 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  32.14 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  36.5 
 
 		 450 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  43.08 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0053  Chromate transporter  38.51 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  35.43 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  25.84 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  32.26 
 
 		 416 aa  72.4  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  30.71 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  27.72 
 
 		 443 aa  71.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  30.71 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  34.12 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  32.03 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  34.12 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  34.12 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  32.48 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.37 
 
 		 441 aa  69.3  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  34.12 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  34.06 
 
 		 418 aa  68.6  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  32.06 
 
 		 432 aa  68.6  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  28.66 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1127  Chromate transporter  26.09 
 
 		 153 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  30.12 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  31.87 
 
 		 460 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  29.33 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  32.94 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  29.41 
 
 		 462 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  30.72 
 
 		 469 aa  65.1  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.07 
 
 		 465 aa  65.1  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  30.36 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  32.7 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  30.89 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  30.34 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.19 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  26.13 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  29.13 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  29.08 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4736  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.25 
 
 		 471 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.53 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.53 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.71 
 
 		 472 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.88 
 
 		 469 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  28.68 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  27.95 
 
 		 401 aa  62  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  29.77 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  29.77 
 
 		 396 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  29.77 
 
 		 396 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  29.77 
 
 		 396 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  29.77 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.71 
 
 		 472 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  28.57 
 
 		 463 aa  62  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>