More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6229 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  100 
 
 
214 aa  417  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  64.58 
 
 
202 aa  211  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  68.24 
 
 
203 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  68.24 
 
 
203 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  68.24 
 
 
203 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  66.67 
 
 
203 aa  204  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  45.18 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  48.91 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  37.04 
 
 
197 aa  105  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  37.79 
 
 
203 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  32.32 
 
 
208 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  36.17 
 
 
199 aa  91.7  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  36.61 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  32.39 
 
 
178 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  38.04 
 
 
199 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  38.04 
 
 
199 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  38.04 
 
 
199 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  37.57 
 
 
185 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  37.5 
 
 
199 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  37.5 
 
 
199 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  37.93 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  32.76 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  37.43 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  34.13 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  35.36 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  33.33 
 
 
196 aa  82  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  36.05 
 
 
196 aa  82  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  34.13 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  36.78 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  39.51 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  32.94 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  32.96 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  34.73 
 
 
443 aa  79.7  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  36.84 
 
 
193 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  40.83 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  37.65 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  33.33 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  39.39 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  47.78 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  39.39 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  37.35 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.79 
 
 
407 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  43.88 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  43.88 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  43.88 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  35.71 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  35.19 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  31.67 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  38.01 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  26.11 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  33.95 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  36.15 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  32.8 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  33.86 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.9 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.07 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.48 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  33.95 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  35.04 
 
 
417 aa  69.3  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.05 
 
 
443 aa  69.3  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  28.16 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  43.18 
 
 
401 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  41.58 
 
 
412 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  43.48 
 
 
402 aa  68.6  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  26.49 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1743  chromate transport protein  34.17 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.22 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  42.86 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  27.43 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  34.74 
 
 
154 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.96 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  26.42 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.35 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  32.3 
 
 
449 aa  66.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  26.83 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  27.5 
 
 
179 aa  67  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  41.58 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  26.83 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  40.86 
 
 
408 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.12 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  36.97 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.19 
 
 
404 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  42.22 
 
 
396 aa  65.5  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  28.65 
 
 
385 aa  65.5  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.28 
 
 
405 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  31.61 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  32.82 
 
 
416 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  41.38 
 
 
401 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  39.18 
 
 
392 aa  63.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  41.38 
 
 
403 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.3 
 
 
390 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  38 
 
 
379 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  26.58 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  41.38 
 
 
401 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  41.38 
 
 
401 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  41.38 
 
 
401 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  29.27 
 
 
393 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  41.38 
 
 
401 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  30.11 
 
 
394 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  36.84 
 
 
418 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>