More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3006 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  100 
 
 
208 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  87.25 
 
 
204 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  85.58 
 
 
204 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  88.21 
 
 
212 aa  275  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  78.06 
 
 
199 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  78.06 
 
 
199 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  81.67 
 
 
185 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  79.35 
 
 
199 aa  257  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  92.66 
 
 
226 aa  255  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  83.25 
 
 
226 aa  255  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  92.66 
 
 
226 aa  255  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  77.04 
 
 
199 aa  255  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  77.04 
 
 
199 aa  255  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  77.04 
 
 
199 aa  255  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  71.35 
 
 
189 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  76.33 
 
 
189 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  74.86 
 
 
202 aa  224  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  63.23 
 
 
215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  60.77 
 
 
199 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  45.71 
 
 
198 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  52.3 
 
 
361 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  46.58 
 
 
187 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  39.88 
 
 
178 aa  136  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  46.2 
 
 
192 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  43.92 
 
 
192 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  43.24 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  42.7 
 
 
185 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  43.35 
 
 
196 aa  124  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  46.71 
 
 
193 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  39.05 
 
 
198 aa  121  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  44.58 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  38.37 
 
 
203 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  39.04 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  40.31 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  37.31 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  44.52 
 
 
209 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  37.64 
 
 
196 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  39.16 
 
 
199 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  36.56 
 
 
191 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  42.86 
 
 
202 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  35.98 
 
 
196 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  42.24 
 
 
198 aa  101  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  36.22 
 
 
190 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  38.22 
 
 
202 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  33.52 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  41.57 
 
 
203 aa  92  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  36.26 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  31.37 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  38.42 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  39.88 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  39.88 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  38.5 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.62 
 
 
415 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  38.82 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  43.03 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  28.65 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.86 
 
 
441 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  38.28 
 
 
450 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  30.93 
 
 
483 aa  75.1  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  28.06 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  31.19 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  35.29 
 
 
418 aa  72.4  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.18 
 
 
405 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  30.99 
 
 
454 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  30.61 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  29.52 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  38.02 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  30.64 
 
 
449 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0300  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.04 
 
 
467 aa  70.1  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178358 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0648  chromate transporter  33.56 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  36.54 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  24.42 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  27.32 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  31.4 
 
 
428 aa  68.9  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  39 
 
 
396 aa  68.6  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  30.34 
 
 
456 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  40.74 
 
 
407 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  32.3 
 
 
453 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  32.8 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1127  Chromate transporter  28.57 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  28 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  27.93 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  23.67 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  28.03 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  29.59 
 
 
442 aa  67.8  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.72 
 
 
395 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  42.5 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  38.32 
 
 
408 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  32.54 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  40.54 
 
 
425 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  36.02 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  29.46 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  30.6 
 
 
456 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.75 
 
 
469 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  33.14 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.03 
 
 
441 aa  65.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  28.57 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  27.13 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  25.64 
 
 
390 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  40.59 
 
 
417 aa  65.1  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>