More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2533 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2533  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 
348 aa  648    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  66.36 
 
 
358 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.99 
 
 
386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.24 
 
 
387 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.24 
 
 
387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  39.08 
 
 
393 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  41.64 
 
 
379 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  44.03 
 
 
376 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  36.46 
 
 
376 aa  203  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.12 
 
 
404 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.45 
 
 
379 aa  202  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.52 
 
 
391 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  36.18 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  42.17 
 
 
382 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  41.77 
 
 
378 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  39.63 
 
 
389 aa  192  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.12 
 
 
393 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.01 
 
 
352 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  36.52 
 
 
383 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.07 
 
 
382 aa  155  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.15 
 
 
395 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  34.88 
 
 
388 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.7 
 
 
392 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  30.13 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  31.12 
 
 
396 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  31.12 
 
 
396 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  31.12 
 
 
396 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  32.83 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  30.29 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  29.63 
 
 
396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  28.71 
 
 
385 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  31.34 
 
 
390 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  31.34 
 
 
390 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  31.34 
 
 
390 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.82 
 
 
395 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  28.32 
 
 
397 aa  123  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  32.06 
 
 
418 aa  123  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  28.5 
 
 
463 aa  123  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  32.11 
 
 
443 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  27.22 
 
 
383 aa  122  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  32.46 
 
 
417 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  27.15 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  30.81 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  30.38 
 
 
428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  30.46 
 
 
425 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  28.93 
 
 
378 aa  119  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  28.95 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  31.3 
 
 
390 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  30.09 
 
 
412 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  29.61 
 
 
401 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  30.4 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  28.66 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  27.89 
 
 
383 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  30.61 
 
 
430 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.55 
 
 
390 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  31.38 
 
 
403 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  30.88 
 
 
432 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  29.17 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.99 
 
 
400 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  28.1 
 
 
390 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  29.18 
 
 
390 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  29.87 
 
 
415 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  29.17 
 
 
401 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  26.28 
 
 
393 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  28.44 
 
 
380 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  26.01 
 
 
416 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.2 
 
 
408 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.2 
 
 
408 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  24.44 
 
 
408 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.53 
 
 
407 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4248  chromate transporter  26.17 
 
 
450 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  28.65 
 
 
418 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  27.93 
 
 
379 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  27.22 
 
 
408 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.07 
 
 
411 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.07 
 
 
411 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  27.64 
 
 
382 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  27.34 
 
 
397 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.64 
 
 
418 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  28.38 
 
 
418 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  27.51 
 
 
346 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  28.76 
 
 
390 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  29.17 
 
 
402 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  27.42 
 
 
383 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  28.06 
 
 
449 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  26.51 
 
 
393 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  30.32 
 
 
401 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  30.32 
 
 
401 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  30.32 
 
 
401 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  34.57 
 
 
420 aa  99.4  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  30.08 
 
 
403 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  24.02 
 
 
395 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  26.28 
 
 
393 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  31.93 
 
 
460 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  26.79 
 
 
393 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  29.6 
 
 
401 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  26.51 
 
 
393 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  29.31 
 
 
401 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  26.17 
 
 
393 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  24.54 
 
 
393 aa  93.6  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>