More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1103 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1103  chromate transporter  100 
 
 
166 aa  320  8e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.295774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1003  chromate transporter  100 
 
 
166 aa  320  8e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1023  chromate transporter  41.46 
 
 
166 aa  98.2  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  35.09 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  32.54 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1753  Chromate transporter  32.52 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  36.02 
 
 
195 aa  79  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  30.25 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  30.99 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  38.1 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  34.13 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  36.26 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  29.24 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  43.18 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  31.45 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  34.39 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1743  chromate transport protein  40.26 
 
 
187 aa  72  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  35.88 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  32.94 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  33.91 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  34.15 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  30.94 
 
 
186 aa  70.9  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  33.33 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  30.23 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  27.92 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1002  chromate transporter  39.53 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.815212  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  29.09 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  30.77 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  29.88 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1104  chromate transporter  39.53 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.590576  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0104  Chromate transporter  28.19 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000372126  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  30.06 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  31.79 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.5 
 
 
392 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1606  Chromate transporter  47.62 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.8 
 
 
395 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  35.9 
 
 
185 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  29.53 
 
 
383 aa  61.6  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0437  chromate transporter  30.63 
 
 
416 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0466  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.25 
 
 
444 aa  60.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  41.43 
 
 
420 aa  60.5  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.67 
 
 
382 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  29.35 
 
 
389 aa  60.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  32.64 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  34.15 
 
 
397 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0471  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.52 
 
 
430 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.5 
 
 
390 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  30.38 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  34.15 
 
 
408 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.5 
 
 
390 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  40 
 
 
393 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  31.97 
 
 
418 aa  58.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.3 
 
 
387 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  32.93 
 
 
408 aa  58.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  37.08 
 
 
190 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  36.59 
 
 
396 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  36.25 
 
 
385 aa  57.8  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  37.66 
 
 
376 aa  57.8  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  38.96 
 
 
376 aa  57.4  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0924  chromate transporter  31.85 
 
 
400 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.175699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5694  chromate transporter  32.28 
 
 
423 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  40.54 
 
 
399 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  29.24 
 
 
416 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2841  Chromate transporter  30.67 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000452935  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  35.37 
 
 
396 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  35.37 
 
 
396 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  35.37 
 
 
396 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11551  chromate transporter  33.75 
 
 
412 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0167365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  36.25 
 
 
394 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  28.65 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  35 
 
 
401 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  42.22 
 
 
378 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2508  chromate transport protein  27.57 
 
 
189 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2214  chromate transporter  27.57 
 
 
189 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.707988  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1752  Chromate transporter  32.69 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  35.37 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  35.37 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  34.15 
 
 
401 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0443  chromate transporter  33.75 
 
 
412 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  35.06 
 
 
187 aa  55.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3496  Chromate transporter  26.59 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.56 
 
 
472 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0233  Chromate transporter  32.03 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  34.15 
 
 
390 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  33.75 
 
 
390 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  34.15 
 
 
390 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  33.94 
 
 
188 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  34.15 
 
 
390 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0947  chromate transport protein, putative  31.71 
 
 
402 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21257  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  27.38 
 
 
173 aa  55.1  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.7 
 
 
387 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  30 
 
 
393 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.83 
 
 
472 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  29.37 
 
 
198 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0232  Chromate transporter  30.7 
 
 
182 aa  54.3  0.0000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0458  putative chromate transport protein  44 
 
 
177 aa  53.9  0.0000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0394959  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1607  Chromate transporter  28.3 
 
 
188 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  36.59 
 
 
383 aa  53.9  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1743  chromate transporter  31.13 
 
 
433 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  37.84 
 
 
417 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>