193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0197 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0197  chromate transporter  100 
 
 
206 aa  407  1e-113  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2736  Chromate transporter  44.78 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.7368  normal  0.214658 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2840  Chromate transporter  41.79 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  39.39 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1741  chromate transporter  33.33 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  25.86 
 
 
420 aa  61.6  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  29.84 
 
 
428 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  27.33 
 
 
383 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  26.88 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  32.11 
 
 
176 aa  57.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  40.62 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  33.94 
 
 
187 aa  56.2  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  39.71 
 
 
184 aa  55.1  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  27.71 
 
 
193 aa  55.1  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  25.42 
 
 
456 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.43 
 
 
415 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  29.29 
 
 
398 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  32.05 
 
 
399 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  25.99 
 
 
456 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  29.13 
 
 
455 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.51 
 
 
441 aa  52.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  31.34 
 
 
397 aa  52.8  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  38.46 
 
 
172 aa  52.4  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  37.84 
 
 
179 aa  52.8  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  28.44 
 
 
454 aa  51.6  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  25.77 
 
 
394 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  34.62 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  32.99 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1609  chromate transporter  35.09 
 
 
398 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79904  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  25 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  33.8 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1287  chromate transporter  33.78 
 
 
185 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.87 
 
 
447 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.86 
 
 
472 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.9 
 
 
395 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  28.57 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  28.17 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  25.66 
 
 
453 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  30.63 
 
 
174 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.07 
 
 
472 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  27.47 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.3 
 
 
450 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  40.38 
 
 
174 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  23.53 
 
 
402 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  26.92 
 
 
200 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  25.87 
 
 
401 aa  48.5  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  28.05 
 
 
431 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  41.3 
 
 
174 aa  48.5  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 
395 aa  48.5  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  41.3 
 
 
154 aa  48.5  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.26 
 
 
390 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  25.81 
 
 
183 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.26 
 
 
390 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  26.92 
 
 
456 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.14 
 
 
392 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  34.15 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  28.57 
 
 
450 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0727  Chromate transporter  33.33 
 
 
185 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000305738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  26.97 
 
 
185 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  37.74 
 
 
167 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  30.77 
 
 
408 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2707  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.46 
 
 
395 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  28.74 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1603  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.47 
 
 
400 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.312378 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  31.82 
 
 
189 aa  47  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.92 
 
 
400 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  23.26 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2804  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.35 
 
 
470 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  33.33 
 
 
172 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  28.16 
 
 
174 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  28.57 
 
 
450 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  33.9 
 
 
172 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  26.58 
 
 
383 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1606  Chromate transporter  32.81 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  30.51 
 
 
198 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  35.82 
 
 
463 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0232  Chromate transporter  24.85 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0053  Chromate transporter  35.38 
 
 
195 aa  46.2  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  27.78 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  24.72 
 
 
385 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  37.78 
 
 
173 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  29.87 
 
 
202 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.36 
 
 
382 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  28.57 
 
 
176 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  32.47 
 
 
416 aa  45.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  27.17 
 
 
392 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  25.87 
 
 
392 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  25.27 
 
 
183 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  28.28 
 
 
446 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  37.78 
 
 
175 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  37.78 
 
 
176 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  37.78 
 
 
175 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  23.87 
 
 
203 aa  45.1  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  37.78 
 
 
175 aa  45.1  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  37.78 
 
 
175 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0233  Chromate transporter  29.63 
 
 
176 aa  45.1  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  37.78 
 
 
175 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  37.78 
 
 
175 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  23.85 
 
 
390 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  26 
 
 
454 aa  45.1  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>