228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2121 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3336  chromate transporter  78.68 
 
 
402 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2121  chromate transporter  100 
 
 
411 aa  813    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728447  normal  0.051785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1208  Chromate transporter  78.68 
 
 
402 aa  633  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567359  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5694  chromate transporter  62.16 
 
 
423 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2391  chromate transporter  62 
 
 
402 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2273  chromate transporter  61.07 
 
 
423 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0924  chromate transporter  63.36 
 
 
400 aa  488  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.175699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2376  chromate transporter  63.27 
 
 
422 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2355  chromate transporter  63.27 
 
 
401 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1743  chromate transporter  61.79 
 
 
433 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0947  chromate transport protein, putative  64.05 
 
 
402 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2220  chromate transport protein, putative  62.78 
 
 
402 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2075  chromate transporter  63.01 
 
 
397 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.231578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0705  chromate transporter  62.78 
 
 
422 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2539  chromate transporter  63.01 
 
 
397 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1150  chromate transporter  63.01 
 
 
397 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1159  chromate transporter  63.01 
 
 
397 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.725557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1310  chromate transport protein, putative  63.01 
 
 
397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  26.18 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  26.99 
 
 
420 aa  111  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  26 
 
 
399 aa  88.2  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  24.34 
 
 
376 aa  86.7  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  28.76 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  25.07 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  25.56 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  24.86 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  29 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  25.54 
 
 
428 aa  82.8  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.48 
 
 
472 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.74 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.47 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  26.8 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  24.78 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  26.91 
 
 
389 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.43 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  25.33 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  26.59 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  25.57 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  26.13 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  25.14 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  26.37 
 
 
397 aa  77  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  22.84 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.59 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.97 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.2 
 
 
407 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  27.74 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  27.12 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  25.2 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.29 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  24.49 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  25.2 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  25.2 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  22.85 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.92 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  24.23 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  26.4 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  25 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  26.73 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.5 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.09 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  27.66 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  26.23 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  25.97 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  27.63 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  28.41 
 
 
430 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.1 
 
 
390 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.7 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  26.89 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  26.89 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  25.37 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  26.9 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  25 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.82 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  26.47 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  26.78 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  25.32 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  28.01 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.72 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  27.82 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  27.82 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  24.75 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  24.62 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  27.82 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  25.53 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  32.64 
 
 
158 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  24.65 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  26.4 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  25.65 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  24.37 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  24.43 
 
 
383 aa  67  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  24.83 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  24.92 
 
 
430 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  23.12 
 
 
392 aa  65.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  25 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  24.5 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  33.33 
 
 
203 aa  64.7  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  24.14 
 
 
383 aa  63.2  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  26.14 
 
 
390 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  30.53 
 
 
192 aa  63.2  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  24.42 
 
 
398 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
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