229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1208 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3336  chromate transporter  91.79 
 
 
402 aa  742    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1208  Chromate transporter  100 
 
 
402 aa  796    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567359  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2121  chromate transporter  78.68 
 
 
411 aa  626  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728447  normal  0.051785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5694  chromate transporter  65.17 
 
 
423 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0924  chromate transporter  63.89 
 
 
400 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.175699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2391  chromate transporter  63.94 
 
 
402 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2273  chromate transporter  63.94 
 
 
423 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2376  chromate transporter  64.19 
 
 
422 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2355  chromate transporter  64.19 
 
 
401 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1743  chromate transporter  64.19 
 
 
433 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0947  chromate transport protein, putative  62.94 
 
 
402 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2220  chromate transport protein, putative  61.68 
 
 
402 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1310  chromate transport protein, putative  61.79 
 
 
397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2075  chromate transporter  61.79 
 
 
397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.231578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0705  chromate transporter  61.68 
 
 
422 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2539  chromate transporter  61.79 
 
 
397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1150  chromate transporter  61.79 
 
 
397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1159  chromate transporter  61.79 
 
 
397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.725557  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  26.78 
 
 
416 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  25.67 
 
 
420 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  26.3 
 
 
389 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.31 
 
 
472 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  25.15 
 
 
376 aa  90.5  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.16 
 
 
393 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  26.33 
 
 
397 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.89 
 
 
472 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  25.67 
 
 
399 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.02 
 
 
404 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  26.24 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.73 
 
 
382 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  26.49 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  26.85 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  26.23 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  24.63 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  26.4 
 
 
401 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.61 
 
 
386 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  26.15 
 
 
392 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  25.75 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  22.85 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  25.82 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  26.01 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  27.27 
 
 
401 aa  76.3  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  25.43 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  25.33 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  26.11 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  27.86 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  26.3 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  25.28 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  25.43 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  25.28 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  25.28 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  25.65 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  25.8 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.85 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.94 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  23.67 
 
 
397 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  28.57 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.42 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  26.63 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  28.57 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  26.21 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  28.57 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  23.8 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  26.3 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  25.08 
 
 
383 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.95 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  27.9 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  22.93 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.64 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  25.62 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  23.68 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  26.62 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.63 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  25.16 
 
 
393 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  26.21 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  27.71 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  26.71 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  26.3 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  27.22 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.54 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  27.22 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  26.3 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  25.16 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.89 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  26.95 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  27.22 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  23.56 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  26.44 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  25.67 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal 
 
 
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NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  27.25 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  23.93 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  21.99 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  29.57 
 
 
203 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
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NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  25.36 
 
 
450 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  26.03 
 
 
402 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  25.95 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  25.88 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.79 
 
 
407 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  25.08 
 
 
379 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  36.7 
 
 
158 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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