244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2391 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5694  chromate transporter  88.06 
 
 		 423 aa  709    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0924  chromate transporter  87.44 
 
 		 400 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.175699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2273  chromate transporter  99.25 
 
 		 423 aa  795    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1743  chromate transporter  89.72 
 
 		 433 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2391  chromate transporter  100 
 
 		 402 aa  797    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2355  chromate transporter  89.72 
 
 		 401 aa  704    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2376  chromate transporter  89.97 
 
 		 422 aa  704    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1208  Chromate transporter  63.94 
 
 		 402 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0947  chromate transport protein, putative  66.75 
 
 		 402 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21257  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3336  chromate transporter  62.47 
 
 		 402 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2121  chromate transporter  62.16 
 
 		 411 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728447  normal  0.051785 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2220  chromate transport protein, putative  66.75 
 
 		 402 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1310  chromate transport protein, putative  67.53 
 
 		 397 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0705  chromate transporter  66.75 
 
 		 422 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2075  chromate transporter  67.53 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.231578  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2539  chromate transporter  67.53 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1150  chromate transporter  67.27 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1159  chromate transporter  67.27 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.725557  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  24.94 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  27.51 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  27.17 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  28.57 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  28.57 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  28.39 
 
 		 390 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  25.41 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  27.37 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  25.23 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  25.33 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  25.7 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.08 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  26.05 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  24.7 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.06 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  26.47 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  28.43 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  22.94 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  24.64 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  24.24 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  25.58 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  25.41 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  25.58 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  29.03 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  25.58 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  26.1 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  25.58 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  24.83 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.4 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  24.88 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.75 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  27.54 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  26.07 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  22.38 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  26.12 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  25.84 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.55 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  24.65 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  25.3 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.8 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  22.64 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.25 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.88 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  26.04 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  26.33 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  27.08 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  24.34 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  25.78 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  25.78 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  25.78 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  24.56 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  26.67 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.27 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  25.08 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  25.71 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  25.33 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  23.45 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.46 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  26.36 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.27 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  27.61 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  24.56 
 
 		 393 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  26.47 
 
 		 393 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  33.33 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  24.85 
 
 		 393 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  25.54 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  24.56 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  25.15 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  23.81 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  29.53 
 
 		 175 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  29.53 
 
 		 175 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  24.29 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  25.37 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  24.41 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  25.72 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  23.68 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  29.53 
 
 		 175 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  29.53 
 
 		 175 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  24.92 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.18 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.18 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  23.73 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>