237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2376 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0924  chromate transporter  84.83 
 
 
400 aa  657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.175699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5694  chromate transporter  91.21 
 
 
423 aa  759    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2273  chromate transporter  88.33 
 
 
423 aa  729    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1743  chromate transporter  97.79 
 
 
433 aa  764    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2391  chromate transporter  89.97 
 
 
402 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2355  chromate transporter  99.5 
 
 
401 aa  785    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2376  chromate transporter  100 
 
 
422 aa  837    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1208  Chromate transporter  64.19 
 
 
402 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567359  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0947  chromate transport protein, putative  69.53 
 
 
402 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21257  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3336  chromate transporter  62.81 
 
 
402 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2121  chromate transporter  63.27 
 
 
411 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728447  normal  0.051785 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2220  chromate transport protein, putative  67.84 
 
 
402 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0705  chromate transporter  67.84 
 
 
422 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2075  chromate transporter  69.29 
 
 
397 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.231578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1310  chromate transport protein, putative  69.29 
 
 
397 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2539  chromate transporter  69.29 
 
 
397 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1159  chromate transporter  69.03 
 
 
397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.725557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1150  chromate transporter  69.03 
 
 
397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  26.02 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  26.22 
 
 
420 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  27.53 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  27.06 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  25.82 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  24.66 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  26.14 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  26.36 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  25.41 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  26.37 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  24.77 
 
 
397 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  27.22 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  27.86 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  27.51 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  25.68 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.57 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  27.13 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  26.36 
 
 
430 aa  77  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  26.83 
 
 
411 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  27.46 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  26.36 
 
 
425 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  26.55 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  26.59 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  26.59 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  26.59 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  26.04 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.21 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  25.96 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.19 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  26.25 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  26.55 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  25.96 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  24.61 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  23.64 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  26.76 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  27.57 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  25.68 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  25.17 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.71 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  25.78 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  25.72 
 
 
403 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  24.49 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  24.79 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2707  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.84 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  28.25 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  22.52 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  25.53 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.08 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  25.53 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  26.14 
 
 
413 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  25.8 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  26.84 
 
 
398 aa  67  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  26.32 
 
 
390 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  25.75 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  23.42 
 
 
401 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  34.15 
 
 
158 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  23.48 
 
 
404 aa  66.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  25.34 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  21.45 
 
 
383 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.52 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.77 
 
 
400 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  30.5 
 
 
175 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  29.66 
 
 
175 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  29.66 
 
 
175 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  30.5 
 
 
175 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  29.66 
 
 
175 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  24.57 
 
 
383 aa  63.5  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.15 
 
 
393 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  26.71 
 
 
401 aa  63.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  24.63 
 
 
412 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  27.14 
 
 
378 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  25.6 
 
 
396 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  29.66 
 
 
175 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  30.25 
 
 
174 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  25.6 
 
 
396 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  29.66 
 
 
175 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  27.12 
 
 
396 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  24.56 
 
 
390 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  25.6 
 
 
396 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.97 
 
 
407 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  22.48 
 
 
472 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  26.56 
 
 
401 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>