More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2665 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  100 
 
 		 208 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  69.54 
 
 		 206 aa  269  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  69.04 
 
 		 206 aa  268  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  50 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  47.12 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  45.13 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  47.94 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  46.7 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  43.65 
 
 		 195 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  42.72 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  44 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  46.19 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  45.69 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  42.79 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  44.85 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  43.07 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  42.33 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  40.48 
 
 		 211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  41.21 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  40 
 
 		 211 aa  134  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  42.41 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  40.49 
 
 		 211 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  39.7 
 
 		 205 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  40.31 
 
 		 221 aa  131  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  39.6 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  39.2 
 
 		 205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  42.78 
 
 		 210 aa  127  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  41.26 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  40.93 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  42.93 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  41.53 
 
 		 277 aa  123  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  40.1 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  40.69 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  41.62 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  40.53 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  41.27 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  36.92 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  37.5 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  42.94 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  37.23 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  37.95 
 
 		 233 aa  101  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1822  16S rRNA methyltransferase GidB  37.64 
 
 		 234 aa  97.4  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0318  16S rRNA methyltransferase GidB  34.21 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.309267  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  40.12 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2267  16S rRNA methyltransferase GidB  35.47 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344279 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2394  16S rRNA methyltransferase GidB  37.08 
 
 		 222 aa  89.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  39.29 
 
 		 205 aa  88.2  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0209  16S rRNA methyltransferase GidB  36.26 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.444443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  34.78 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  40.65 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  38.36 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2200  16S rRNA methyltransferase GidB  38.82 
 
 		 220 aa  85.1  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  37.34 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  32.95 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  36.18 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  37.42 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  36.59 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  36.54 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  32.84 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  39.66 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0029  16S rRNA methyltransferase GidB  37.57 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  37.2 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  37.2 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  36.99 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  36.36 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  37.42 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  37.42 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  30.81 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  37.42 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0895  methyltransferase GidB  32.17 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  38.99 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0027  16S rRNA methyltransferase GidB  36.81 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  34.68 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3463  glucose-inhibited division protein B  34.1 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  35.48 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  37.65 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  35.39 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  37.32 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  32.95 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  36.31 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  32.73 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  34.94 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  36.81 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  34.39 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  35.39 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  35.5 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  36.84 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  35.19 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  36.59 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  33.89 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  36.81 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  34.29 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0050  16S rRNA methyltransferase GidB  35.52 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.368551  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1398  16S rRNA methyltransferase GidB  36.62 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046822  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  28.98 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  33.33 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  32.22 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14160  glucose-inhibited division protein B  34.94 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  31.93 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>