More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4104 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 205 aa  408  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  57.14 
 
 		 213 aa  211  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  55.61 
 
 		 208 aa  207  9e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  54.03 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  54.29 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  55.45 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  54.19 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  52.5 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  53.92 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  51.74 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  49.26 
 
 		 215 aa  197  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  50.24 
 
 		 219 aa  197  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  50.74 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  50.7 
 
 		 226 aa  195  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  51.23 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  51.23 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  48.76 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0027  16S rRNA methyltransferase GidB  50.94 
 
 		 226 aa  194  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  51.23 
 
 		 216 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  50.68 
 
 		 235 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  52.61 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  48.26 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  49.31 
 
 		 225 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  51.98 
 
 		 210 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0029  16S rRNA methyltransferase GidB  52.71 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  50.25 
 
 		 216 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  51.96 
 
 		 231 aa  191  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  47.55 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  47.55 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  47.55 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  49.52 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2769  16S rRNA methyltransferase GidB  47.09 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5740  16S rRNA methyltransferase GidB  48.76 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0209353  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  50.24 
 
 		 228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  45.71 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  46.34 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  49.76 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  54.55 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  48.78 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0052  16S rRNA methyltransferase GidB  48.13 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  45.73 
 
 		 208 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  49.75 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  42.42 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  42.42 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  42.42 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  42.42 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  49.75 
 
 		 228 aa  177  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  42.42 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  42.42 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  42.42 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  49.75 
 
 		 228 aa  177  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  42.42 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  43.22 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  48.29 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0074  16S rRNA methyltransferase GidB  45.24 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  48.47 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3981  16S rRNA methyltransferase GidB  49.51 
 
 		 213 aa  174  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  43.41 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  46.08 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  49.51 
 
 		 213 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2945  16S rRNA methyltransferase GidB  49.51 
 
 		 213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.373809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1598  16S rRNA methyltransferase GidB  49.51 
 
 		 232 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.140153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0189  16S rRNA methyltransferase GidB  49.51 
 
 		 232 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3366  16S rRNA methyltransferase GidB  49.51 
 
 		 213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0050  16S rRNA methyltransferase GidB  45.12 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.368551  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3004  16S rRNA methyltransferase GidB  49.51 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  44.27 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  46.46 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3786  16S rRNA methyltransferase GidB  48.57 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.393771  decreased coverage  0.000261644 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  42.64 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  42.64 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  42.64 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  45.59 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  46.67 
 
 		 212 aa  168  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  44.22 
 
 		 211 aa  168  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  47.5 
 
 		 214 aa  167  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  42.64 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  42.19 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  42.64 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  50 
 
 		 208 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2879  methyltransferase GidB  44.28 
 
 		 220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2336  methyltransferase GidB  45.92 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000208151  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  42.08 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1064  16S rRNA methyltransferase GidB  45.93 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3966  16S rRNA methyltransferase GidB  40.3 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3654  16S rRNA methyltransferase GidB  43.35 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.611058  hitchhiker  0.00060095 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  43.52 
 
 		 223 aa  158  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3505  16S rRNA methyltransferase GidB  47.49 
 
 		 235 aa  157  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  46.67 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  44.2 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  46.67 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4496  16S rRNA methyltransferase GidB  38.31 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227983  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0001  16S rRNA methyltransferase GidB  41.38 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.895325  hitchhiker  0.000116578 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  39.6 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  40.1 
 
 		 211 aa  154  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4027  16S rRNA methyltransferase GidB  41.38 
 
 		 206 aa  154  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.537471  normal  0.874868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3935  16S rRNA methyltransferase GidB  41.38 
 
 		 206 aa  154  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.387591  hitchhiker  0.000403371 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  40.11 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4757  16S rRNA methyltransferase GidB  41.38 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4376  16S rRNA methyltransferase GidB  40.39 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000253102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>