More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0095 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 228 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  98.68 
 
 		 228 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  94.74 
 
 		 228 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  92.98 
 
 		 228 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  92.51 
 
 		 228 aa  427  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  92.98 
 
 		 228 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  92.98 
 
 		 228 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  76.09 
 
 		 231 aa  345  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0189  16S rRNA methyltransferase GidB  74.22 
 
 		 232 aa  327  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1598  16S rRNA methyltransferase GidB  74.22 
 
 		 232 aa  327  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.140153  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3004  16S rRNA methyltransferase GidB  74.22 
 
 		 230 aa  327  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0029  16S rRNA methyltransferase GidB  74.07 
 
 		 227 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  76.89 
 
 		 213 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3366  16S rRNA methyltransferase GidB  76.89 
 
 		 213 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2945  16S rRNA methyltransferase GidB  76.89 
 
 		 213 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.373809  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  71.88 
 
 		 225 aa  317  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3981  16S rRNA methyltransferase GidB  75.94 
 
 		 213 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  71.69 
 
 		 227 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  56.8 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  58.6 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  57.28 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  56.31 
 
 		 222 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  51.55 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  51.23 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3855  16S rRNA methyltransferase GidB  46.92 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  47.86 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2769  16S rRNA methyltransferase GidB  46.67 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  52.71 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  50.97 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  52.68 
 
 		 213 aa  187  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  52.22 
 
 		 214 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0027  16S rRNA methyltransferase GidB  47.53 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  47.53 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  48.47 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  48.47 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  48.47 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  48.47 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  48.47 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  48.47 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  48.47 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  48.47 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  46.01 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  50.77 
 
 		 206 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  48.5 
 
 		 206 aa  181  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  50.26 
 
 		 216 aa  181  7e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4496  16S rRNA methyltransferase GidB  44.08 
 
 		 206 aa  181  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227983  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  50.77 
 
 		 206 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  48.78 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  49.76 
 
 		 205 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  50.77 
 
 		 206 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0001  16S rRNA methyltransferase GidB  44.28 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.895325  hitchhiker  0.000116578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4250  16S rRNA methyltransferase GidB  42.65 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4320  16S rRNA methyltransferase GidB  44.78 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000104223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4517  16S rRNA methyltransferase GidB  44.78 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4375  16S rRNA methyltransferase GidB  44.78 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4376  16S rRNA methyltransferase GidB  44.78 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000253102  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  47.72 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3935  16S rRNA methyltransferase GidB  44.28 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.387591  hitchhiker  0.000403371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  48.28 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  49.75 
 
 		 214 aa  178  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  43.24 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4908  16S rRNA methyltransferase GidB  43.13 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127096  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  47.32 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  42.65 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3654  16S rRNA methyltransferase GidB  49.46 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.611058  hitchhiker  0.00060095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4027  16S rRNA methyltransferase GidB  43.78 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.537471  normal  0.874868 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4757  16S rRNA methyltransferase GidB  43.78 
 
 		 206 aa  175  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  45 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  46.15 
 
 		 214 aa  175  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  48.08 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0074  16S rRNA methyltransferase GidB  48.36 
 
 		 226 aa  174  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  47.06 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  46.38 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  47.06 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  46.97 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  53.14 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3762  16S rRNA methyltransferase GidB  43 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.247019  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  44.44 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  47.94 
 
 		 207 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  47.94 
 
 		 207 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  47.94 
 
 		 207 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  45.32 
 
 		 216 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  46.57 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  47.94 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  49.73 
 
 		 210 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  47.18 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3966  16S rRNA methyltransferase GidB  41.79 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181169  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0052  16S rRNA methyltransferase GidB  46.02 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  45.23 
 
 		 211 aa  168  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  47.42 
 
 		 207 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3505  16S rRNA methyltransferase GidB  47.44 
 
 		 235 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  46.19 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0050  16S rRNA methyltransferase GidB  45 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.368551  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  44.72 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5740  16S rRNA methyltransferase GidB  47.29 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0209353  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  45.16 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1064  16S rRNA methyltransferase GidB  43.16 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  42.6 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  47.37 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  39.72 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>