More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1835 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 245 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  56.72 
 
 		 226 aa  211  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  52.55 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  52.04 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  48.64 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  51.53 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  48.47 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  48.29 
 
 		 213 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  48.29 
 
 		 213 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  47.6 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  49.21 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  50.52 
 
 		 212 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  49.23 
 
 		 212 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  48.94 
 
 		 277 aa  169  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  48.15 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  50.52 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  45.77 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  49.47 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  47.09 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  45.79 
 
 		 221 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  42.03 
 
 		 205 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  47.47 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  47.94 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  44.55 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  47.47 
 
 		 205 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  47.18 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  47.18 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  40.82 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  43.07 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  49.47 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  43.48 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  46.56 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  44.04 
 
 		 223 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  42.71 
 
 		 211 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  43.72 
 
 		 195 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  43 
 
 		 207 aa  133  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  43.37 
 
 		 193 aa  131  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  47.37 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  41.29 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  38.27 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  38.29 
 
 		 233 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  36.93 
 
 		 236 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  31.71 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  30.32 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  32.07 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  34.19 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  40.97 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  34.68 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  38.56 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0052  16S rRNA methyltransferase GidB  34.38 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  31.84 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 		 256 aa  72  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  36.09 
 
 		 236 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  37.42 
 
 		 209 aa  72  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  33.74 
 
 		 217 aa  72  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  32.93 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  24.46 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  28.76 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  33.74 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  36.13 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  29.01 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  30.11 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  29.24 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  28.65 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  34.19 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  28.86 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  33.11 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  36.18 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  24.55 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  25.33 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0745  glucose inhibited division protein  32.68 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  26.88 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  27.74 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  31.93 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  32.96 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  29.07 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  29.29 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  32.14 
 
 		 226 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1700  methyltransferase GidB  31.5 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 210 aa  67  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0042  methyltransferase GidB  32.47 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  29.29 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  31.35 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0895  methyltransferase GidB  23.47 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  32.96 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  30.43 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  33.97 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  34.04 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0074  16S rRNA methyltransferase GidB  29.17 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  25 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  30.19 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3463  glucose-inhibited division protein B  33.33 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0617  16S rRNA methyltransferase GidB  37.29 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  31.5 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  34.93 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  36.18 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  29.59 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  32.37 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  30.19 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  34.83 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>