More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3929 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  88.29 
 
 		 205 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  70.3 
 
 		 213 aa  291  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  62.19 
 
 		 211 aa  259  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  54.59 
 
 		 213 aa  207  9e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  54.59 
 
 		 213 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  52.02 
 
 		 213 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  51.78 
 
 		 210 aa  191  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  45.13 
 
 		 215 aa  185  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  46 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  52.05 
 
 		 221 aa  161  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  47.47 
 
 		 245 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  44.16 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  42.29 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  41.79 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  41.67 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  43.88 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  42.13 
 
 		 233 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  41.12 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  43.43 
 
 		 277 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  42.13 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  50 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  41.67 
 
 		 211 aa  137  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  38.58 
 
 		 211 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  41.03 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  38.07 
 
 		 211 aa  131  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  39.7 
 
 		 208 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  40.51 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  39.59 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  41.45 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  39.11 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  39.8 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  40.7 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  39.09 
 
 		 209 aa  127  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  38.58 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  34.92 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  36.87 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  41.58 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  33.5 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  38.93 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  31.58 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  37.16 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  39.6 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  31.9 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  36.36 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  33.52 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  32.64 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2769  16S rRNA methyltransferase GidB  39.13 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  33.79 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  39.1 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  30.5 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1077  methyltransferase GidB  33.09 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.471113  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  35.04 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  26.21 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  33.95 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  27.98 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0895  methyltransferase GidB  28.97 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  38.97 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  32.92 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  28.3 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  30.29 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  33.14 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  27.22 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  30.07 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  32.92 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  30.37 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  28.47 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  34.55 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0383  16S rRNA methyltransferase GidB  32.3 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  29.75 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  30.43 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  35.92 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  32.41 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1015  methyltransferase GidB  31.65 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0089498  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  27.08 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  32.7 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  28.57 
 
 		 227 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3357  methyltransferase GidB  25.62 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  31.72 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  31.72 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  28.68 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  32.02 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  27.12 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  29.45 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  35.21 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  28.67 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1605  glucose inhibited division protein  32.64 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0792  methyltransferase GidB  31.85 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00321601  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  30 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1398  16S rRNA methyltransferase GidB  31.75 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046822  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  28.74 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  35.94 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  33.97 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  28.38 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  26.24 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  30.11 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  28.29 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>