More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4508 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  100 
 
 		 254 aa  489  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  50.78 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  54.27 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  54.68 
 
 		 213 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  54.9 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  54.68 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  56.92 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  55.68 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  51.53 
 
 		 223 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  53.23 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  51.74 
 
 		 242 aa  185  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  61.54 
 
 		 205 aa  181  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  51.2 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  59.63 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  54.1 
 
 		 227 aa  178  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  54.64 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  50.25 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  49.33 
 
 		 225 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  50.87 
 
 		 242 aa  171  7.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  53.76 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  53.8 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  50 
 
 		 210 aa  169  5e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  50.96 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  51.32 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  51.34 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  51.34 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  51.34 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  51.6 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  49.51 
 
 		 306 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  47.44 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  48.04 
 
 		 212 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  45.18 
 
 		 210 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  46.7 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  58.17 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  48.6 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  43.35 
 
 		 228 aa  132  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  38.25 
 
 		 255 aa  128  7.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  39.3 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  27.43 
 
 		 239 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  26.99 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  32 
 
 		 242 aa  99  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  37.2 
 
 		 205 aa  98.6  8e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  29.68 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  32.76 
 
 		 240 aa  97.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  37.57 
 
 		 236 aa  95.5  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  34.34 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  35.9 
 
 		 212 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  44.37 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  32.24 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  45 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  38.12 
 
 		 208 aa  92.4  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  39.16 
 
 		 236 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  32.24 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  36.96 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  27.97 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  32.73 
 
 		 209 aa  90.1  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  34.87 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  30.43 
 
 		 207 aa  89.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  40.26 
 
 		 210 aa  89  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  31.95 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  30.35 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  34.66 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  30.81 
 
 		 205 aa  86.3  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0209  16S rRNA methyltransferase GidB  35.4 
 
 		 238 aa  86.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.444443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  37.93 
 
 		 211 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  34.69 
 
 		 207 aa  85.9  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  32.18 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2879  methyltransferase GidB  37.28 
 
 		 220 aa  85.9  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  32.18 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  30 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  32.57 
 
 		 239 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  32.57 
 
 		 239 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  40.74 
 
 		 209 aa  85.1  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  30.86 
 
 		 210 aa  85.1  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  40.85 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  33.75 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  30.18 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  38.46 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  35.59 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  32.1 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  34.66 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  34.16 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  31.14 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  37.93 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  35.03 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0318  16S rRNA methyltransferase GidB  32.92 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.309267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  30.93 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2267  16S rRNA methyltransferase GidB  33.77 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>