More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2156 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  100 
 
 		 222 aa  434  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  57.56 
 
 		 210 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  52.51 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  47.44 
 
 		 254 aa  158  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  53.01 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  51.53 
 
 		 306 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  53.71 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  51.98 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  54.75 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  51.98 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  55.7 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  49.23 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  53.49 
 
 		 241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  48.94 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  49.43 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  52 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  53.61 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  51.76 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  48.97 
 
 		 221 aa  147  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  44.1 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  50.55 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  53.37 
 
 		 223 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  48.5 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  48.04 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  54.44 
 
 		 223 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  50 
 
 		 227 aa  141  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  48.28 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  54.22 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  50.99 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  48.52 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  47.9 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  45.11 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  46.82 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  50.3 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  47.1 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  44.31 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  53.29 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  38.38 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  43.71 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2267  16S rRNA methyltransferase GidB  36.77 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344279 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  40.38 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  30.67 
 
 		 231 aa  92  6e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  37.2 
 
 		 229 aa  91.7  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  41.03 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  41.03 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  42.45 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  37.91 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  40.77 
 
 		 208 aa  88.6  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  35.37 
 
 		 239 aa  88.6  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  40.49 
 
 		 193 aa  88.6  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  34.21 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  38.61 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  43.97 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  30.81 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  37.9 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  34.42 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  39.16 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  39.24 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  39.29 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  39.1 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  30.43 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  30.23 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  34.52 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  40.65 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  40.94 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  29.27 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  35.62 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  37.9 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  35.53 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  40.56 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  42.73 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  43.09 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  34.29 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  42.73 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  27.95 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  35.53 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  40.15 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  43.09 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  42.73 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  34.87 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  35.53 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  29.79 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  39.45 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  35.53 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  36.59 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  31.21 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  41.28 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  36.84 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  36.84 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  39.04 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  35.09 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  36.84 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  35.17 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  34.87 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  34.87 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  36.6 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  30.61 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  38.97 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  28.42 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  28.42 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>